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随着改革开放和社会主义现代化建设的不断深入，提高政府行政效率，增强政府经济调节、市场监管、社会管理和公共服务成为各政府部门的工作重点，在实现以上工作目标的过程中，信息化工作发挥着越来越重要的作用，而电子政务作为政府工作信息化的重要表现形式也越来越受到重视。知识产权作为国家自主创新的标志，中国政府在近些年越来越重视这方面的工作，商标权作为知识产权的重要组成部分之一在社会主义市场经济中发挥出越来越重要的作用。商标自动化系统是信息化工作在商标局的具体表现形式的体现，该系统在提高商标审查效率，为社会提供网络服务方面发挥着重要的作用。但是，随着中国商标申请量的不断增加，以及国际商标合作的要求越来越高，现有的商标自动化系统已经无法满足工作的需求，存在着诸多方面的不足与问题。因此，如何建设完善的商标自动化系统，利用先进的信息技术来提高工作效率和质量，在依法行政的同时做到服务社会公众，是摆在商标主管行政机关面前的重大课题。 本文综合运用文献综述法、案例分析法以及比较分析法等研究方法，在对电子政务概念进行分析的基础上，旨在研究电子政务在中国商标注册管理中的应用，评价其应用成果，分析目前存在的主要问题，并力求提出对策建议。 文章认为商标自动化系统有效地促进了商标局的行政效率和工作质量的提高;促进了商标局依法行政和科学管理水平的提升，在一定程度上遏制了腐败现象的滋生;提高了商标局向社会提供公共服务的整体水平，并初步产生良好的社会效益。与此同时，商标自动化系统仍存在一些亟待解决的问题:如缺少法律的规制和保障;自动化系统运行方式与传统行政体制的不匹配;网上申请系统的开展不足;与国际局交流的电子化程度不足。 通过加强立法，制定关于电子政务的纲领性法律法规，并修订、完善部门立法，有望突破法律瓶颈;克服传统行政模式、习惯的影响，及时调整组织机构，优化重组业务流程，使自动化系统的效能进一步提高;加强人员的自动化知识与法律知识的培训，更大程度的发挥自动化系统的作用;不断完善网上申请，真正方便所有商标业务参与者;开发与国际局的电子通讯系统，实现数据传输的自动化与无纸化，为中国商标与世界的交流奠定基础。