面向肺脑结构识别的医学图像处理关键算法研究

来源 :东北大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:missao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着医学成像技术的不断发展,各种医学图像在肺部、脑部疾病的临床检测、诊断和治疗中得到了广泛普及。现阶段临床中每天都可以产生海量的医学图像,阅读大量医学图像并对图像内容进行精准的判断,会大大增加医生的负担,严重降低工作效率,给临床应用造成了不利的影响。
  利用基于计算机的医学图像处理技术自动提取肺部、脑部结构并对其展开定性、定量或多时相的分析可为肺部、脑部疾病的临床应用提供客观、无侵入、可重复的诊断信息,具有重要的理论研究和实际应用价值。但现有研究识别各类结构的性能还存在局限性,容易导致后续应用产生错误的分析结果,进而干扰疾病的检测、诊断和治疗过程,给患者的健康和生命带来严重风险。因此,本文面向肺气管树、肺叶组织和脑脊液、脑灰质、脑白质等结构,提出了针对性的算法从CT或MR图像中识别这些结构,力求在算法精度、速度和鲁棒性方面取得提高,主要研究工作包括如下内容:
  (1)针对现有肺气管树分割算法在处理不同成像条件下的CT图像时发生的过分割(泄漏)和漏分割现象,提出了一种基于自适应模型的CT图像肺气管树分割算法,由区域生长分割模型从CT图像中检测肺气管树,再针对分割泄漏提出了泄漏处理模型,两种模型的参数均根据肺气管树分割过程自适应地计算,减少了根据经验设置的参数造成在不同成像条件下CT图像中气管被漏分割的现象。本文将气管分支按照图像特征分类,采用顺序的处理流程分割各类分支,每类分支的提取结果都为下一类分支提供了分割参数与种子点集合:先提取肺气管树主干分支,再采用区域生长模型与泄漏模型提取次级和细小气管分支,最后基于肺气管树的拓扑形态检测终末气管分支,完成对整个肺气管树的分割。该算法在EXACT09数据集和NTNU数据集中测试,与当前有代表性的算法相比取得了更高的精度、速度和鲁棒性结果。
  (2)为了避免因肺气管树分割结果中通常存在的表面不平滑或内部空腔等缺陷,导致现有算法在中心路径提取后出现大量毛刺或环状分支等异常结构,进而影响对其它分支结构的提取精度,本文提出了基于图论的肺气管树分支结构提取算法。采用拓扑细化算法提取初始中心路径,基于图论获得该路径的树状拓扑结构,并根据解剖学先验信息移除该路径中的异常分支,保持了真实肺气管树的拓扑学形态。再从优化后的中心路径中提取气管分支的起始点、末梢点、方向、几何学和解剖学等级,划分分支区域,并计算分支直径。该算法与EXACT09数据集的参考分支结构信息对比结果具有很高的一致性,对含分割缺陷的数据处理也具有很高的精度和鲁棒性。
  (3)小气道分支是以内径狭小为特征的气管,现有肺气管树分割算法提取小气道分支精度有限。本文提出了基于机器学习的CT图像小气道分割算法,在一组样本标注不完整的数据集上实现了对小气道的检测。为尽可能地给分类器提供高质量的样本,提出了基于小气道解剖学和图像学先验知识的自动样本提取算法;同时结合了基于图像局部梯度的管状特征和图像纹理特征,获得多尺度特征集,训练随机森林分类器对图像中的像素点进行分类,将小气道区域从图像学特征相似的肺实质中有效分离。该算法与一组经过手动优化的参考数据比较,大幅度提高了小气道分支的检出率,同时可以很大程度地避免假阳性小气道分支的产生。
  (4)由于现阶段全自动、高精度和鲁棒的CT图像肺叶组织分割仍难以实现,为提高不同扫描时相CT图像在肺叶边界位置的配准精度,本文在缺乏肺叶分割结果的前提下,提出了一种基于肺叶信息的多时相肺部CT图像配准算法。根据肺裂纹的图像特征提出了肺裂纹度增强滤波,根据肺叶支气管的解剖结构先验知识,提出了肺叶支气管特征点和肺叶支气管距离梯度增强变换场,结合这些肺叶信息提出了联合的配准相似性代价函数,采用多级B样条形变模型对最大吸气末和呼气末屏气扫描中的肺组织进行空间变换,实现配准流程。该算法在DIR-Lab数据集和CREATIS数据集中测试,有效提高了不同时相CT图像中肺组织整体和肺叶边界区域附近的配准精度。
  (5)为了减少MR图像噪声和灰度不均匀现象造成分割结果中出现不连续区域或在组织边界处出现偏离的问题,本文提出了一种基于MR图像的脑组织分割算法,改进了经典Gaussian混合模型,基于Markov随机场理论,在混合模型中提出了基于图像局部分割类别熵的先验概率权值,对组织类别先验概率和组织灰度后验概率进行有效结合,将组织分割信息有效地与混合模型相融合,不断修正分割过程中产生的噪声区域和边界位置。该算法在BrainWeb数据集和IBSR数据集中测试,与金标准结果具有很高的相似性,在精度、速度和鲁棒性方面都比部分有代表性的算法更具优势。
  综上,本文有效改善了CT和MR图像中提取肺部和脑部重要结构所存在的问题,提高了各结构识别的精度、速度和鲁棒性,对拓宽相关方向可采用的算法和解决思路、发挥国产医疗成像设备优势、推动产品竞争力和临床应用具有重要的理论和实用意义。
其他文献
该论文以SnO电催化电极的制备及性能评价为主要研究内容,对所制备电极对特定有机污染物、农药废水的电化学降解性能进行了评价,并对电极结构与电催化特性之间的关系,以及苯酚的电化学降解机理进行了初步探讨.该论文优化了Sb掺杂SnO电极的制备工艺,以苯酚为目标有机物、以苯酚的电化学降解效率和电极的稳定性作为指标,实验确定了涂层制备方法、涂层厚度、热处理工艺条件、Sb掺杂量等工艺条件.设计并制备了三种电极中
学位
该项目为云南省自然科学基金资助项目,项目编号为:20010034.课题中采用液相催化氧化法对低浓度HS净化进行了实验研究.实验结果表明:对HS浓度在1500~2500mg/m之间,氧含量在21﹪的尾气,Fe、Zn、Mn三种金属离子在液相下对HS具有催化氧化作用,PH值越高,溶液的净化效果越好,在高氧含量条件下,三种金属离子的催化性能大小顺序为:Fe>Zn>Mn,且Fe催化性能远远大于其它两种离子,
学位
纳米TiO光催化氧化技术是一项正在兴起的现代新型水处理技术,对多种有机物污染物有明显的降解效果,因而具有广泛的应用前景.该论文采用溶胶一凝胶法制得的纳米TiO膜,分别以脱墨废水和含氯酚废水作为处理对象,利用自行设计的光催化反应器对TiO光催化作用的影响因素和降解特性进行了研究,并对氯酚的降解动力学及降解规律进行了初步探讨.
学位
稀土上转换发光纳米晶体是将低能量光子转变为高能量光子的一种反斯托克斯发光的功能材料,由于其可将近红外光转变为可见光甚至是紫外光而备受研究者的青睐。上转换荧光具有众多优势,如发射峰可调节,荧光稳定性高,发射峰宽度窄,寿命长,细胞毒性相对较低和受背景干扰小。因此稀土上转换发光纳米材料在生物领域具有很大的应用潜力。  本论文中,我们主要研究了高掺杂稀土发光纳米材料在生物活体成像及肿瘤治疗方面的应用。具体
基于已开发的一种用于近红外荧光成像的荧光探针-荧光激活蛋白(Fluorescence activated protein,FAP)来探究肿瘤细胞的成像及杀伤。荧光激活蛋白是一类可特异识别无荧光的荧光原小分子的蛋白,通过结合限制荧光原在空间上的自由转动,降低其非辐射衰减,从而产生荧光信号。这种成像技术的优点是由于单独的荧光原和FAP均不产生荧光信号,只有在特异结合时才产生荧光激活,成像时无需去除未结
根据受感染部位的不同,真菌感染性疾病可分为浅部真菌感染、皮下真菌感染和系统性真菌感染。侵袭性真菌感染包括皮下真菌感染和系统性真菌感染。侵袭性真菌感染危害显著,是医院感染的重要类型。真菌感染发病慢,死亡率高,虽有抗真菌药物可用于临床治疗,但其死亡率依旧居高不下。与真菌有关的死亡病例中大部分由以下四种真菌引起,即:隐球菌、念珠菌、曲霉和肺孢子虫。  新型隐球菌引起的感染,是条件致病感染,但在免疫正常与
鱼类骨骼肌不仅是体内的主要蛋白质储存库,还是代谢活跃和适应代谢变化高度可塑性的组织。KLF15(Krüppel-likefactor15)是KLF家族中羧基端具有高度保守锌指结构域的转录因子,其在调节肌肉组织中支链氨基酸(branched chain amino acids, BCAA)代谢方面发挥重要功能,对维持生物体的血糖稳态具有重要意义。BCAA是唯一一类在骨骼肌中发生高度代谢的必须氨基酸,
学位
计算机断层摄影术(CT)是一种常用的临床医学成像技术。CT可以很好的实现椎体骨折和不稳定损伤检测,因而广泛应用于临床诊断。由于腰椎承受了身体大多数的力量,在遭遇较强外力时容易造成压缩性骨折。在临床诊断中,初期和中期的压缩性骨折在椎骨形态上形变较小,大多数情况医生会出现误诊以至于加重骨折程度,因此需要十分精确的分割结果才能更好的辅助医生进行诊断。但是临床中的手动分割耗时耗力且不同的医生分割的结果不同
目的:通过构建肠黏膜免疫紊乱的肠-视网膜神经损伤模型,明确肠黏膜免疫紊乱引起的视网膜损伤表型,以及Microglia/Macrophage在免疫-神经损伤中的作用,并进一步研究Steaps对Microglia/Macrophage功能的影响,从而揭示Steaps调控的Microglia/Macrophage在肠-视网膜损伤中的免疫调节机制,为肠脑轴相关疾病的免疫机制探索提供参考。  方法:构建DS
一直以来,扫描时间过长是制约磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)发展的主要因素,因此快速磁共振成像(fast MRI)是磁共振研究领域的重要课题之一。基于多线圈阵列的并行磁共振成像方法和基于压缩感知理论的快速磁共振成像方法是fast MRI这一领域的两大重要阶段。近几年,随着大数据和深度学习的快速发展,神经网络成为快速磁共振成像领域新的突破。然而,目前基于深度