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在高等动物中，爬行动物是真正陆生脊椎动物的原祖，在系统演化上有重要地位，因而备受关注。线粒体DNA结构简单、进化速度快、无组织特异性，现已被较多的运用到爬行类亲缘关系及种群遗传结构分析的研究。
本论文选取广东省汕头市南澳岛、广东省肇庆市鼎湖山自然保护区、广东省广州市华南师范大学、香港特别行政区、四川省成都市、美国Florida州以及BVI(British Virgin Islands)Guana Island地区的6种壁虎科动物以及5种滑蜥作为研究对象，从肝脏中提取线粒体DNA，以其为模版扩增了线粒体12SrRNA基因部分序列，并对其进行了序列测定，采用分析软件比较了分布于不同地区物种的亲缘地理关系。
通过对几种壁虎科动物的12SrRNA基因部分序列分析比较后，得出主要结论如下：
(1)在所测得的12SrRNA基因序列中A+T含量为51.5％，G+C含量为48.5％，A+T含量略高于G+C含量。
(2)中国壁虎和蹼趾壁虎种内的核苷酸变异位点较多，美国的蜥虎H.mabouia以及截趾虎种内变异不大。
(3)物种间的遗传距离显示无蹼壁虎与铅山壁虎之间的亲缘关系非常近；长弯脚虎和灰弯脚虎之间亲缘关系非常近；大壁虎与其它壁虎之间亲缘关系相对其它壁虎较远。
(4)蹼趾壁虎种内遗传距离最大，原尾蜥虎种内没有发生遗传分化。
(5)蹼趾壁虎分布类型属于南北间断分布，由于长期的地理隔离，不同地理群体间已发生了遗传分化。通过对几种滑蜥的12SrRNA基因部分序列分析比较后，得出主要结论如下： (1)宁波滑蜥种内的核苷酸变异位点较多，并且这些变异位点全部是有简约信息的多态位点。南滑蜥仅具有一个变异位点。
(2)遗传距离显示：美国的滑蜥S.lateralis与中国南部的香港、南澳岛、鼎湖山地区以及四川的滑蜥具有很近的亲缘关系，说明滑蜥分布类型。
(3)香港的宁波滑蜥和南澳岛的宁波滑蜥存在差异，揭示可能和岛屿历史地理成因有关。
(4)推测滑蜥属演化途径是以宁波滑蜥为中心，分为三支，一支进化为秦滑蜥，进一步进化为S.lateralis；一支进化为Scincella indet，一支进化为南滑蜥。