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Neuregulin(NRG)是一类在神经系统、心脏以及多种器官系统中介导细胞间相互作用的信号蛋白.近期研究表明,NRG-1β亚型可作为广谱抑制剂,治疗由各种疾病引起的心力衰竭.论文的第一章综述了NRG与受体酪氨酸激酶研究的进展.在论文的第二章中,我们结合同源模建、分子动力学和自由能计算方法对NRG-1β与受体酪氨酸激酶的相互作用机制进行了探索.首先,我们采用同源模建方法建立NRG-1β/ErbB3和NRG-1β/ErbB4复合物的三维结构,用分子动力学对配体/受体模型进行了模拟,得到了与定点突变非常一致的结果,这说明模建得到的理论模型是很可靠的;然后,通过MM-PBSA方法(丙氨酸扫描计算)研究了配体的残基对配体-受体结合的贡献.β-分泌酶是切割β-淀粉样前体蛋白APP产生Aβ的关键酶,是产生老年性痴呆症的关键因素之一.在论文的第三章,首先,通过对抑制剂-β-分泌酶复合物晶体结构进行分析,揭示了抑制剂-β-分泌酶相互作用的重要特征.然后,针对β-分泌酶的晶体结构,用分子对接程序DOCK从SPECS数据库筛选出打分在前5000名的小分子;再根据β-分泌酶抑制剂药效团作为限制条件对这些分子进行复筛,从中我们选取约2500个符合药效团的分子.在论文的第四章,我们与中科院上海生命科学研究院生物信息学中心合作,通过生物信息学分析,推测SARS冠状病毒的核壳体N蛋白与人环胞素A受体(hCypA)可能存在相互作用,表面等离子共振(SPR)实验证实了它们之间具有很强的亲和作用(KD为6~160nM).在此基础上,我们采用同源模建方法建立了N蛋白和hCypA复合物的三维结构.理论模型表明N蛋白与hCypA活性口袋作用的区域为Trp302~Pro310的环区,定点突变实验和MM-PBSA自由能计算结果很好地证实了这个结合模型的合理性.N蛋白与hCypA的这种相互作用模型为探索SARS感染人体细胞的可能途径提供了线索,并为抗SARS药物的研究提供了一条可行的途径.