【摘 要】
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丹参（Salvia miltiorrhizaBunge）属于双子叶植物唇形科鼠尾草属植物，是中国传统中药，主要以干燥根部入药。丹参具备的特征有：生长期短、易培育、繁殖方式多样、对环境要求低、基因
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丹参（Salvia miltiorrhizaBunge）属于双子叶植物唇形科鼠尾草属植物，是中国传统中药，主要以干燥根部入药。丹参具备的特征有：生长期短、易培育、繁殖方式多样、对环境要求低、基因组小、染色体数目少（2n=16）等，有利于分子生物学和遗传学的分析。丹参作为重要的传统中药，针对它的高通量测序、功能基因研究、体内药用成分的分析和作用机理等研究也纷纷展开。本研究以中条山二倍体植株和中条山突变体为材料展开。为了更好的了解突变体产生根部粗大的机制，我们在对对照组和实验组提取了RNA之后，运用Illumina二代测序方法进行了转录组测序并进行分析。本研究主要结果如下： 1.用去壁低渗法对中条山丹参和突变体进行核型分析，结果表明，突变体植株较正常二倍体细胞核内多了一条小染色体段片； 2.转录组测序数据经除杂组装后共得到46770条Unigene，长度在1Kb以上的有15394条。基因结构分析获得ORF46481个，SSR有63058个，SNP位点有1005151个； 3.中条山二倍体丹参与突变体的差异表达分析，得到差异基因数目为5087条，其中表现上调的基因有2230条，表现下调的基因有2857条。 4.通过生物信息学对测序数据进行注释，包括与NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO数据库的比对，共获得33,586条Unigenes注释结果。 5.通过qPCR，成功验证了18个基因的相对表达量与测序结果一致，证明了测序数据的准确性。 6.挑选出了几个与细胞分裂，抗逆和根生长相关的基因，并对其进行了序列分析。其中两个与根生长相关基因进行克隆，构建了遗传转化载体，成功的转入了拟南芥对基因的功能进行初步的分析。
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