基于基因组测序的海洋链霉菌W007次生代谢产物的研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hitlic2009
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海洋中高压、低温、缺氧等独特的生态环境以及生物多样性的特点赋予了海洋链霉菌种类、遗传和生态功能的多样性,而这些多样性正是海洋链霉菌次级代谢产物多样性的物质基础。海洋链霉菌W007分离自青岛胶州湾海底沉积物,其发酵产物对农业病害真菌黄瓜炭疽病菌、黄瓜黑星病菌、桃褐腐病菌、杏疤病菌、芦笋茎枯萎病菌有较强的抗性,在农业真菌病害防治上有潜在的应用价值。为了分析其抗农业病害真菌的组分,对其发酵产物进行了分离纯化,发现了对人肺癌细胞具有较强细胞毒作用的新颖的Ⅱ型聚酮化合物3-hydroxy-1-keto-3-methyl-8-methoxy-1,2,3,4-tetrahydro-benz[α]anthracene。为了进一步评估海洋链霉菌W007次生代谢产物合成能力,利用454 GS FLX技术,对海洋链霉菌W007进行全基因组测序,并对其基因组结构进行了分析,在W007的基因组上发现了潜在的Ⅰ和Ⅱ型聚酮合酶基因簇、烯二炔合酶基因簇、非核糖体多肽合酶基闪簇等,通过对这些功能基因的分析发现,链霉菌W007具有产生聚酮,烯二炔及聚肽等化合物的潜力。在对链霉菌W007次级代谢产物进一步的分离纯化中,获得1个具有新颖结构的和6个已知的augucyclione类抗生素,3个具有新颖结构的异苯并呋喃衍生物。结合基因簇信息,对augucyclione类抗生素与异苯并呋喃衍生物可能的生物合成途径进行了分析,为比较基因组学、基因簇的功能研究及进一步的组合生物合成奠定了基础。本研究将基因组学与传统天然产物分离研究相结合,为新结构活性化合物的发现和优化提供了方法学基础。
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