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克雅氏病是可传播性海绵状脑病中的一种，为一类侵袭人类中枢神经系统的可传播退行性脑病，潜伏期长，100％致死率。在TSE发病过程中，正常的PrP向致病的PrP的转化被认为是最为重要和关键的步骤，近年来的研究资料提示细胞膜表面的穴样内陷结构有可能是PrP蛋白转化发生的重要部位。
ApoE是载脂蛋白中的一种，通过定位于细胞膜的包涵素（clathrin）被覆区域即被覆小凹（Coated pits）上的一种经典的细胞内化受体-低密度脂蛋白受体与配体结合形成的复合体，再通过包涵素介导的内吞途径，来清除血液中的脂类物质，并通过内化调控细胞的生长发育。
ApoE与AD疾病的发生发展关系密切，而近几年的一些实验证据也显示ApoE和CJD可能存在某种联系。因此我们利用RT-PCR技术，从人神经母细胞瘤系SSY-5Y克隆出载脂蛋ApoE3 cDNA全序列，亚克隆至原核表达载体pET32a。在大肠杆菌中表达蛋白通过Ni-NTA Agarose纯化出HIS-ApoE3蛋白。同时我们表达了ApoE不同的异构体ApoE2及ApoE4，并利用Ni-NTA Agarose获得了纯化的ApoE2及ApoE4蛋白。用ApoE3免疫新西兰大白兔，制备TApoE的克隆抗体，抗体效价ELISA检测结果为1：406，900。产生的抗体具有良好的免疫反应性，能够识别动物脑组织中天然的ApoE蛋白，并且也能识别基因工程表达的截短的ApoE蛋白及ApoE的不同的异构体。
通过免疫共沉淀、GST pull-down和EUSA等技术证明全长载脂蛋白ApoE2及ApoE3，ApoE4都能够与全长的重组PrP结合，且结合能力没有明显差别；为了寻找PrP与ApoE相互作用的区域，我们构建了并表达了PrP N端的第23－90位蛋白PrP23.90，表达了PrP23－231和PrP91－231，利用EUSA和免疫共沉淀的方法证明结合部位位于PrP的N端（23.90）。为了进一步寻找ApoE与PrP的结合区域，我们又分别构建和表达了ApoE蛋白的N端（1－194 aa）和C端（195－299 aa）多肽。利用GST pull down和免疫共沉淀的方法证明了ApoE蛋白主要通过其N端（1－194aa）与PrP蛋白发生相互作用。为了进一步证明在肝组织中的天然ApoE也与PrP发生了相互作用，我们利用GST以及His pull down方法进行实验，结果证明肝组织中的天然ApcE和PrP能够发生相互作用。这些结果从分子水平提供了ApoE与PrP蛋白相互作用的实验证据，为进一步研究细胞膜表面的穴样内陷结构在PrP蛋白构象转化中的意义，探讨prion疾病的发病机制提供了一定的科学依据。