山羊促卵泡素受体基因部分序列的克隆与单核苷酸多态性分析

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本研究将FSHR基因作为繁殖性状的候选基因,对其5′调控区和第一外显子进行扩增、测序、序列比较和PCR-SSCP检测,以期探索该基因序列在不同山羊品种及畜种之间的差异和其多态性对母羊繁殖和超排效果的影响,进而为增加山羊排卵数和提高胚胎可用率提供依据。本研究共得到以下结果: 1.本研究表明,莱芜黑山羊、崂上奶山羊和波尔山羊三个品种的FSHR基因5′序列长度在品种之间差异较大,其中波尔山羊为981bp,莱芜黑山羊为968bp,崂山奶山羊为969bp,且这种差异主要来自碱基插入/缺失的数目差异。以波尔山羊序列为准,莱芜黑山羊出现11个碱基替换和13个碱基缺失,崂山奶山羊出现11个碱基替换和13个碱基缺失和1个碱基插入,而序列同源性高达99.69%的莱芜黑山羊与崂山奶山羊之间仅出现3个碱基的突变或缺失。 2.PCR-SSCP分析发现FSHR基因5′-1序列存在SSCP多态性,而5′-2、5′-3、5′-4没有多态性。5′-1出现AA和AB两种基因型,测序结果发现杂合基因型AB在FSHR基因的5′-1序列的第52个碱基处发生突变,由G到A。统计表明,FSHR基因的5′-1突变位点的优势基因型为AA型,优势等位基因为A,其中纯合基因型AA在群体中的频率较高,为0.8400,等位基因A的基因频率为0.9200。X~2检验表明,波尔山羊群体X~2=0.7056,P=0.4009(P<0.05)处于Hardy-Weinberg平衡状态。多态信息含量分析显示5′-1片段PIC=0.1364,波尔山羊群体的多态信息含量为低度多态。 3.分析发现AA基因型波尔山羊母羊与AB基因型波尔山羊母羊超排的平均排卵数差异极显著(P=0.001),其平均胚胎可利用率差异显著(P=0.044),而年龄及年龄*基因型交互效应对排卵数和胚胎可利用率的影响不显著。
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