lncRNA DANCR在红系分化过程中的功能研究

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由造血干细胞通过增殖、分化生成红细胞是一个动态复杂的过程,其调控涉及到多个阶段和层次。其中,转录因子等对红系分化的调控已经得到了广泛的研究。目前已有研究发现,在红系分化过程中,非编码RNA,尤其是lncRNA表达呈现强烈的阶段特异性和较差的种属保守性。在这一背景下,我们对这些特异性表达的lncRNA在红系分化中发挥的作用十分感兴趣。本文利用人脐带血来源的造血干细胞及体外诱导其向红系分化的各个时期的转录组数据,通过生物信息学分析,得到了8个对红系分化有潜在调控作用的lncRNA。结合体外诱导K562、TF-1红系分化细胞模型的实验研究,最终确定DANCR作为后续研究对象。  首先,在K562和TF-1红系分化细胞模型中过表达DANCR之后,发现DANCR能够促进珠蛋白基因、血红素合成过程中的限速酶ALAS2编码基因的表达。利用hemin对K562细胞进行红系分化诱导,发现过表达DANCR在红系分化过程中能够促进珠蛋白基因、ALAS2基因表达、CD235a和CD71在细胞表面的表达。另外,过表达DANCR的K562细胞血红蛋白浓度增加速率明显高于对照组,但细胞生长速度减慢。以上结果说明,DANCR能够促进红系分化。此外,我们对过表达DANCR的K562细胞进行了转录组测序,GO聚类与蛋白质相互作用等生物信息分析结果说明,DANCR会促进红系分化,并且其作用机制可能是通过抑制KIT等基因与后续信号通路的相互作用。  综上,本文首先利用已有的转录组学数据,找到了潜在调控红系分化的lncRNA。后续将表型实验与转录组学数据分析相结合,不仅证明DANCR对红系分化的促进作用,还揭示了其可能的作用机制。
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