用支持向量机预测Ⅱ类主要组织相容性复合体分子结合多肽

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用实验方法确定哪些多肽片段可与某一特定的MHC分子结合需要大量重叠的多肽片段.对鉴定结合多肽的理论预测可以大大减少所需合成和分析的多肽数量,从而促进潜在T细胞表位的鉴定.支持向量机作为一种新型的模式识别和分类方法,具有在有限样本情况下很好的学习与预测能力.我们用支持向量机对HLA-DR4(B1*0401)编码的Ⅱ类MHC分子结合多肽进行了预测.将通过实验测试已知结合能力的多肽序列分为两组,一组用于训练,一组用于测试.然后将测试组的多太序列经过预处理,输入支持向量机及模板产生测试结果.将所测试的结果与其它方法的结果进行比较.
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