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残留物分析是凭借自然科学技术手段，从残留物载体上提取考古残留物，通过分析鉴定其生物来源，从而获得丰富的古代“潜”信息。近二十年来，国外学者运用多种方法从古代动植物的利用及加工、器物功能和先民食谱等角度对考古残留物进行了研究，故而国际上的残留物分析领域业已取得一系列令人瞩目的研究成果。然而，相较国外发展，我国残留物分析的研究工作尚未普遍展开，但却应该是考古研究中的重要环节。因此，系统开展残留物分析的研究工作以攫取更多古代人类社会的信息显得尤为重要。
鉴于此，本文从残留物分析的研究现状出发，首先归纳总结了残留物的种类和来源，并梳理了残留物分析的各种研究方法，以探索不同类别残留物的适用方法。然后，选取具有代表性的考古材料，采用相对成熟领域的多种方法对其进行测试分析，并结合相关的文献资料和考古背景，获得考古残留物所蕴含的古代信息，探讨其考古学意义，以期建立比较系统的、完善的考古残留物分析方法，为以后考古残留物的分析研究提供有价值借鉴。
本论文的主要研究成果为，采用傅立叶变换红外光谱、植物微体化石分析、蛋白质组学、稳定同位素分析、拉曼光谱、X射线荧光光谱和离子色谱等方法，对我国出土的若干淀粉类、脂类、蛋白类、炭化类、颜料/染料和液体类等残留物的来源开展了深入分析和鉴定，有效地揭示出其蕴含的考古信息。
论文研究中借鉴了几种新的分析方法（种子表皮细胞分析，蛋白质组学技术，离子色谱分析），旨在为解决残留物的来源鉴别、加工工艺等问题开拓新的研究思路，并成功地揭示出这些研究手段在残留物分析中的可行性及应用前景。