核受体PXR、FXR蛋白异二聚体及两者与尼莫地平复合物的结构生物学研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:whf19
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
核受体(nuclear receptor,NR)是一类在进化上高度相关,具有共同的结构特征并能够结合特定DNA的转录因子。迄今为止,在人体内已经鉴定了48种核受体。核受体转录因子可以和其他蛋白质及辅激活因子共同行使转录调节功能,上调或下调体内特定功能基因的表达,在糖脂代谢、炎症反应、细胞增殖、凋亡分化过程中起着重要的作用,也与很多疾病密切相关,是多种疾病的治疗靶点。本论文主要采用蛋白晶体学手段,围绕核受体家族的两个成员法尼醇X受体(FXR)和孕烷X受体(PXR)开展研究:一方面对二者与视黄醛X受体α(RXRα)的异二聚体复合物结构进行探索;另一方面对PXR、FXR分别与小分子药物尼莫地平的相互作用进行分析。
  目前对核受体结构的研究,主要集中在其单独的配体结合结构域(LBD)上,而对于行使转录调控功能的多结构域全长核受体蛋白,其结构受蛋白表达、纯化和结晶难度的限制,至今只有四个家族成员被解析出来,极大限制了对核受体转录调控模式和规律的深入研究,特别是新作用机制药物的发现。而PXR和FXR作为与糖脂代谢、炎症反应最为密切相关的核受体家族成员,成为了越来越重要的代谢性疾病药物靶点。尤其近年来研究发现,肠道菌群也可以通过调节FXR,进而影响胆汁酸循环和糖脂代谢,从而与肥胖等代谢性疾病相关联,使肠道菌群-FXR轴成为新的研究热点。因此对两者与RXRα异二聚体全长复合物结构的研究,一方面有助于直观地展示核受体蛋白不同结构域之间变构信号传递的方式,另一方面可为进一步针对两类核受体通路开发相关药物提供重要信息。
  其次,小分子药物1,4-二氢吡啶类(1,4-DHP)钙离子通道拮抗剂(CCB)作为全球最常用的抗高血压单药治疗药物之一,除了用于治疗高血压外,还可以防止多种化学物质如四氯化物(CCl4)、氯仿等引起的体内肝损伤,但其具体保护机制目前并不清楚。而核受体PXR和FXR作为在肝脏保护中起着重要作用的两种核受体,很有可能作为该类药物的非靶向性受体发挥肝脏保护机制。因此通过晶体学分析揭示该类药物与两种核受体的结合机制,不但能为开发下一代靶向性更强、疗效更好的CCB提供参考,还能为肝保护药物的开发提供一系列潜在的苗头化合物。
  综上所述,本文通过结构生物学的相关常规手段,利用大肠杆菌原核表达系统进行了核受体蛋白的异源表达,并通过镍柱亲和层析、离子交换层析和凝胶过滤层析等蛋白纯化方法,制备了两种核受体与RXRα的蛋白复合物,筛选了蛋白晶体的生长条件。另外通过共结晶的方式,获得了两种核受体LBD与1,4-DHP类药物尼莫地平的复合物结构。后续我们将会继续进行两种核受体异二聚体蛋白纯化和结晶条件的探索,并深化对尼莫地平及更多1,4-DHP类药物识别和调节两种核受体的作用机制研究。
  
其他文献
随着代谢工程和合成生物学的发展,芳香族化合物的生物合成备受关注。肉桂胺是由L-苯丙氨酸衍生而来的一种芳香族化合物,主要应用在生物活性分子、活性药物、含能材料的合成等方面,具有较大的研究价值。肉桂胺主要通过化学法合成,但是该方法具有污染大、成本高的弊端。目前,以肉桂胺生产为目标的生物合成法还未报道,迫切需要我们建立一种高效的肉桂胺生物合成方法。本文致力于大肠杆菌中从肉桂酸到肉桂胺的生物合成途径的构建
网箱养殖产生大量生物沉积物,生物沉积物在沉积物中的积聚进而影响沉积环境的理化性质和沉积物的生物相,理论上形成网箱养殖区及其毗连水域间的生态交错带。然而,对于网箱养殖区及其毗连水域生态交错带的研究极其匮乏,生态交错带的确定有助深入认识网箱养殖的环境效应、网箱养殖区及其毗连水域间的互作。为了解决上述问题,本研究于海南省马袅湾开展网箱养殖区及其毗连水域的沉积物中有机物、不同赋存形态磷含量及大型底栖生物生
学位
海带(Saccharina japonica)是一种在我国实现大规模人工养殖的经济型海藻,其表面附生细菌对海带生长、发育起着至关重要的作用。本研究以养殖的海带为研究对象,在养殖不同时期采集新鲜海带、海带养殖区海水和养殖区外海水,使用16SrRNA基因扩增子测序技术研究海带表面附生细菌群落和海水水体细菌群落结构的多样性和动态变化过程;并以海带附生细菌群落多样性较低和最高的海带样品作为分菌来源,进行了
学位
学位
多杀菌素是一种细胞内的二次代谢制造出的产物,其一般是在好氧发酵过程中由Saccharopolysporaspinosa生成的。作为生物农药的多杀菌素产品,可以用来杀死田地里的害虫,防治储存的谷物中的害虫。特别是对草地贪夜娥有着明显的破坏性影响,这些场景在中国是非常常见的,也因此多杀菌素无疑将在国内有广泛的应用前景,多杀菌素靶向性强,对哺乳动物的生命健康几乎无影响,没有致癌性、催畸形性、变异原性、神
学位
表面活性剂在食品工业,化妆品,石油工业和污水处理等各领域的应用令其成为工业生产中使用最多和推崇的化学品之一。然而,大多数化学合成的表面活性剂衍生自石油产品,大量的石油消耗已经导致资源枯竭和环境污染。因此,必须解决对生态友好,可生物降解和可再生的表面活性剂替代品开发的相关问题。近年来,生物表面活性剂因其良好的生物降解性和生物相容性,较低的毒性,热稳定性和在极端条件下的耐受性越来越受到人们的关注。槐糖
周质空间是革兰氏阴性细菌特有的细胞结构。与革兰氏阳性细菌不同的是,在革兰氏阴性细菌中,细胞壁的肽聚糖层之外还包被有一层外膜结构。外膜和内膜这两层膜结构之间所包围的空间,就是革兰氏阴性细菌的周质空间。作为革兰氏阴性细菌特有的一种最基本的细胞结构,一个稳定的周质空间对于革兰氏阴性细菌的生命活动来说是极其重要的。而要维系住周质空间的结构,最核心的是维持住外膜结构的稳定性。在大肠杆菌中,有多种蛋白参与并执
自然界中的硫循环与氮循环、碳循环等过程密切相关,并可以通过各种生物地球化学过程相耦合。海底是进行生物地球硫循环的主要场所。无机硫的海洋循环主要包括H2S的氧化以及硫酸盐的还原。在海底沉积物中,硫酸盐可以作为有机物矿化的电子受体在厌氧区域被还原为H2S,产生的大量H2S又可以扩散到上层的含氧区域经过多步反应再次生成硫酸盐。目前,尽管存在着大量相关的研究,但关于H2S如何在海洋沉积物中被氧化仍没有非常
链霉菌(Streptomyces)是一种在自然界广泛分布的革兰氏阳性细菌。它在复杂的生长发育过程中,能产生抗生素、活性酶、免疫抑制剂等次级代谢产物。这些产物种类多、活性高,在工农业、医药业及生物防治等领域被广泛应用,具有重要的应用和研究价值。链霉菌的模式菌株为天蓝色链霉菌,已于2002年完成全基因组测序,其基因组中不仅含有多个次级代谢产物的生物合成基因簇,同时还存在多个调控基因,可编码包含67对典
学位
乳酸菌长期应用于食品发酵,是安全级微生物;同时它也是肠道菌群的正常组分,在胃肠道存活且有多重益生作用。因此,乳酸菌是合成食品添加剂、生物治疗药物等功能性产品的优良底盘细胞和传递载体。番茄红素是由8个异戊二烯单元构成的萜类化合物,作为自然界中的强抗氧化剂,它随着食物或药物进入人体后发挥抗氧化、抗辐射、防癌抗癌等多种生理作用。以食品级乳酸菌为宿主菌合成番茄红素具有安全性高、无需提取可直接以活菌形式服用