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microRNA是一类21-25nt的小分子RNA,在个体发育、细胞分化、细胞增殖与死亡、细胞代谢及多种生理疾病中发挥着重要作用。由于miRNA长度的限制,直接克隆非常困难。我们利用了金由辛组建立的Smart Switch方法克隆miRNA,并加以了优化。首先利用poly(A)polymerase和reverse transcriptaseM-MLV(RNaseH-)特殊的smart switch活性,只需两步反应就可分别在microRNA的3和5端加上相应的adaptor,仅需2小时就可快捷、准确地获取miRNAcDNA文库,比以往常用的RNA ligase的miRNA克隆方法(一般需要2天)方便快捷得多,而且,由于该方法中无需RNA回收操作,所以RNA损失非常少,大大提高了miRNA eDNA文库的完整性。
在获取miRNA cDNA文库的基础上,我们通过PCR扩增反应,利用本实验室自己发展建立的miRNA芯片,获取了新生大鼠附睾发育期间的miRNA表达谱(1-10周龄)。研究结果表明,有63个miRNAs有较强的信号(信号值≥10000),其中43个miRNAs是在大鼠附睾发育过程中有明显差异表达的(P<0.05,且差异≥2.5倍):其中23个miRNAs为表达上调,20个miRNAs表达下调。而其他20个miRNAs的表达没有明显的变化。我们从芯片数据中挑选了变化趋势规律较为明显的6个miRNAs(miR-742、743a、141、200a、411和369-5p)进行了RT-PCR和northernblot验证,验证结果与芯片结果基本一致。而这6个miRNAs在各组织中的表达分布结果显示,miR-742和miR-743a是在大鼠生殖系统中(睾丸和附睾)特异性表达的。
此外,我们用双荧光素酶报告系统和western blot方法,观察mir-742和mir-743a对其相应靶基因翻译的抑制效果。结果表明,miR-742和miR-743a能够分别地显著抑制NFAT5和CYP2681蛋白的表达,这暗示NFAT5和CYP2681分别就是miR-742和miR-743a的靶基因。