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我国是世界上猪饲养量最大的国家，养猪业在我国畜牧业中占有重要的地位，养猪生产占畜牧业产值35％左右，其中母猪的繁殖力是养猪生产水平高低和能否获得高效益的核心。研究表明繁殖障碍是导致母猪淘汰的首要原因，而母猪的繁殖受到下丘脑-垂体-卵巢性腺轴的控制，在性腺轴的调控下，母猪卵巢黄体和卵泡交替发生，发情周期周而复始。垂体是最复杂也是最重要的的内分泌腺，它可以影响内分泌腺的活动，对卵巢功能的调控具有重要的作用，而且垂体组织表达丰富的miRNA，参与垂体的基因表达调控。已有研究表明猪垂体表达丰富的miRNA。miRNA由约22个核苷酸构成，通过与靶mRNA的3’非翻译区(3’-untranslated region，3-UTR)结合，从而降解靶mRNA或抑制转录物的蛋白翻译。miRNAs可能在调控垂体-性腺轴的功能发挥重要的作用。分析母猪卵泡期和黄体期垂体的miRNA表达谱，有助于揭示在不同生殖周期中垂体特异的miRNAs及相关基因调控的网络，从而更清楚地了解下丘脑-垂体-卵巢性腺轴在卵巢周期的分子作用机制，这对高产母猪的选育和保种及对繁殖障碍疾母猪的分子机制探讨提供有用的参考信息。 本研究以长大二元母猪作为研究对象，对处于黄体期(HC)和卵泡期(HF)的长大二元母猪垂体miRNA表达谱进行分析，从两个时期中垂体差异表达miRNAs入手，对部分差异miRNAs与生物信息学预测的靶基因的调控关系进行验证。主要获得以下结论： 1在HC与HF两文库样本高质量的Clean reads分别为17476445和16225364条，其中长度为21-23nt的序列分别占73.68％和75.53％。小RNA分类注释显示，两文库中与已知miRNA匹配的序列数分别为55.49％和54.66％。 2从HC和HF两个文库中分别鉴定到猪保守miRNA中的227和224个，以及11个miRNA*。差异表达分析显示，2个文库中共有61个已知的miRNAs显著差异表达；相对于HF，HC上调的miRNA有51个，下调的miRNA有10个。 3通过Mireap，在HC文库中预测到178个pre-miRNA，在HF文库中预测到161个pre-miRNA，分别对应238和204个成熟miRNA，其中包括在其他物种中己发现的26个成熟miRNA。 4运用RT-PCR技术检测19个miRNA的表达，其中包括猪已知的、哺乳动物间保守的miRNA10个，新预测的miRNA9个，其中有17个在HC、HF垂体组织的表达结果与高通量测序结果相一致，表明本研究测序数据真实准确。 5通过生物信息学预测HC和HF显著差异miR-135靶基因为c-fos，通过Sensorreporter实验对靶基因验证，结果为阴性，c-fos不是mir-135的靶基因。