实验用巴马小型猪SLA-DQB1基因克隆及分子特征分析

来源 :2014第十一届中国实验动物科学年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jimmycjriyue
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目的:为了研究实验用巴马小型猪SLA-DQB1基因的分子特征,为实验用巴马小型猪SLA单倍型猪群的建立奠定基础. 方法:采集20头(7 ♂,13♀)小型猪的抗凝血,分离外周血淋巴细胞,提取RNA,RT-PCR扩增SLA-DQB1基因,结合克隆测序和直接测序结果,获得DQB1等位基因序列,根据其序列特征设计序列特异性引物,建立PCR-SSP方法验证等位基因,并利用软件分析其分子特征. 结果:成功获得了6个DQB1等位基因,其中3条为新发现等位基因,PCR-SSP方法验证结果显示,扩增获得了预期的目的片段;序列遗传多态性分析发现,大部分变异位点集中在β1结构域,氨基酸非同义突变数明显高于同义突变数,且MHC Ⅱ类分子与外源性抗原结合的15个氨基酸中,有5个氨基酸具有保守性;同源比对以及系统进化树分析发现,巴马小型猪与人具有较高的同源性,且具有相近的亲缘关系. 结论:本研究成功鉴定了6个DQB1等位基因,并分析了其分子特征,新等位基因的识别对巴马小型猪发展为经典实验动物和生物医学模型具有至关重要的作用.
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