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目的：筛选并确定对獐牙菜苦苷进行生物转化的菌种。方法：采用黑曲霉、米曲霉、康氏木霉、大肠杆菌和短乳杆菌与獐牙菜苦苷分别培养的方式，并应用HPLC方法检测各发酵液的色谱行为，计算獐牙菜苦苷的代谢率，以评价各菌种对獐牙菜苦苷的生物转化效果。结果：黑曲霉、米曲霉和康氏木霉可以对獐牙菜苦苷进行代谢，并产生了三个主要代谢产物，代谢率依次为36％、15%和8%；在大肠杆菌和短乳杆菌的转化液中没有发现相关代谢产物峰的存在，表明其对獐牙菜苦苷基本不代谢。结论：采用黑曲霉生物转化獐牙菜苦苷，效果较好。