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地方高校向应用技术型高校转型发展的过程中，通过校企合作与企业形成互惠共赢的共同体，最根本的就是探索行业企业参与的新型治理结构。行业企业与地方高校在管理中的权力分配问题、尺度问题、权力制衡问题等是当前地方高校转型治理结构中存在的突出问题。地方高校向应用技术型高校转型应设立由行业企业等组成的高校董事会、专业指导委员会，建立监察委员会健全监督机制，确立和完善以“企业参与、党委领导、校长管理、教授治学、群众监督”的新型治理结构。