光合水分解机理的ABEEMσπ/MM/M和BS-DFT研究

来源 :第十二届全国量子化学会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gaohenghao
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  光合作用作为地球上最基本的生命活动之一,一直受到科学界广泛的关注和研究.光合系统Ⅱ 中进行的水分解和氧气的形成,是由光合释氧络合物(OEC)在光和周围氨基酸、水分子的驱动下的协调完成的.这个过程伴随各种复杂的物理和化学变化,仍然存在很多争议和未解之谜1.本文针对底物水分子的结合位点和形成方式,S 态循环中各物质的相对自由能变化,以及S2 态g≥4.1 EPR signal 的B 异构体2 下氧气生成的可能性作了探讨.ABEEM/MM/MD 分子动力学模拟结果显示,W1 不是底物水分子Wf,这点与氨结合OEC 的实验结果相符3;S2→S3 转化之前,Ca 上的配体水分子W3 离去,逐渐结合到Mn(Ⅲ),成为它的第六个配体;从空间距离看,它极有可能作为快交换速率水Wf,在S4 态与O5(Ws)结合成氧分子,同时也支持Siegbahn 提出的通过自由基耦合的O-O 键形成机制4.BrokenSymmetry DFT 的计算表明,S2-A 和B 异构体在S4 态的O-O 键形成步骤上具有相似的活化自由能,从而说明S2 态的B 异构体也有可能在接下来的转化中导致氧分子的生成5.
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