【摘 要】
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人类基因组图谱绘制完成后，尤其近几年来测序技术快速的进步和生物信息学的迅猛发展，人们越来越多地从基因和基因组层面去对生命现象和机理进行研究。随着生物序列的爆炸式增长，对海量数据的分析和可视化已成为生命科学领域的一项重要课题，基因组数据可视化在基因结构分析，功能研究等方面具有重要意义。由于基因组数据十分庞大，相较于桌面式基因组浏览器，基于web的基因组浏览器有着便利性和数据传播等优势而成为主要发展方
【机 构】
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中山大学水生经济动物研究所暨广东省水生经济动物良种繁育重点实验室,广东广州 510275
【出 处】
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第七届全国石斑鱼类繁育与养殖产业化论坛
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人类基因组图谱绘制完成后，尤其近几年来测序技术快速的进步和生物信息学的迅猛发展，人们越来越多地从基因和基因组层面去对生命现象和机理进行研究。随着生物序列的爆炸式增长，对海量数据的分析和可视化已成为生命科学领域的一项重要课题，基因组数据可视化在基因结构分析，功能研究等方面具有重要意义。由于基因组数据十分庞大，相较于桌面式基因组浏览器，基于web的基因组浏览器有着便利性和数据传播等优势而成为主要发展方向。目前功能强大、应用广泛的主要有UCSCGenomeBrowser、Ensembl GenomeBrowser、NCBI Map Viewer、GBrowse、JBrows等；其中UCSC、NCBI和Ensembl应用最为广泛，而GBrowse等新一代基因组浏览器采用了最新的网络技术，且具有开源和可定制的特点从而被多个机构和项目采用。随着斜带石斑鱼(Epinephineus Coioides)基因组的测序、组装和基因注释完成，我们着手构建了石斑鱼基因组数据可视化系统，以方便科研人员对石斑鱼基因的结构和功能展开科学研究。本系统采用了JBrowse基因组浏览器作为核心组件之一，并利用网页技术展示基因序列、结构和功能注释等详细信息。此外，为了更好地辅助分析，本系统整合了Blast等信息学工具，实现了斜带石斑鱼基因组序列、基因结构和注释信息的可视化和分析功能。
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为探讨条纹锯鮨性逆转过程中内分泌调节机理,本文采用药条埋置的方法,分别将17α-甲基睾酮(17α-MT)和芳香化酶抑制剂(AI)药条单独和混合埋置到1+龄条纹锯鮨肌肉中,观察并分析性别转换过程中其组织学特征和生理学变化.结果显示,实验结束后,实验组条纹锯鮨已转化为功能性雄鱼,并获得有活力的精子,而对照组仅有少数个体转雄.(1)实验组条纹锯鮨性腺成熟系数先降低后升高,而对照组则变化不显著.随着埋置药
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基因作为生命信息的承载体,包含着每个生命的全部奥密.基因组的研究,已经成为全面解读一个物种的重要突破口.石斑鱼是我国南方沿海广东、海南、福建等省的重要海水养殖鱼类之一,经济价值巨大.我们选取了斜带石斑鱼(Epinepheluscoioides)、棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)、鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)和赤点石斑鱼(Epineph
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