【摘 要】
:
杂交可以将亲本控制不同性状的优良基因结合于一体,或将亲本中控制同一性状的不同微效基因积累起来,产生在各该性状上超过亲本的类型.不同的石斑鱼种类具有着不同的优良性状,如相对于其他种类石斑鱼来说,鞍带石斑鱼鱼具有生长速度快、赤点石斑鱼具有性成熟周期短以及斜带石斑鱼具有耐受性高的特点.本文利用SLAF-seq技术对14种石斑鱼展开系统的遗传多样性,全基因组标记筛选以及功能基因挖掘研究,筛选出与亲本优良性
【机 构】
:
中山大学水生经济动物研究所暨广东省水生经济动物良种繁育重点实验室,广东广州 510275
【出 处】
:
第七届全国石斑鱼类繁育与养殖产业化论坛
论文部分内容阅读
杂交可以将亲本控制不同性状的优良基因结合于一体,或将亲本中控制同一性状的不同微效基因积累起来,产生在各该性状上超过亲本的类型.不同的石斑鱼种类具有着不同的优良性状,如相对于其他种类石斑鱼来说,鞍带石斑鱼鱼具有生长速度快、赤点石斑鱼具有性成熟周期短以及斜带石斑鱼具有耐受性高的特点.本文利用SLAF-seq技术对14种石斑鱼展开系统的遗传多样性,全基因组标记筛选以及功能基因挖掘研究,筛选出与亲本优良性状相关的标记,进而对杂交子代进行品质鉴定,选择出优良的石斑鱼种间杂交育种组合.研究对象为14种石斑鱼,除三斑只有7个个体外,其他每种石斑鱼有10个个体,共137个个体.分属于2个属,其中13种为石斑鱼属,1种为驼背鲈属.包含8个亲本(鞍带、斜带、老鼠斑、老虎斑、云纹、三斑、青石斑以及赤点石斑鱼)以及6个杂交子代(虎龙、青龙、青红、云龙、红云以及鼠龙斑).对其进行分子标记开发,获得全基因组范围内的分子标记.选择了红缚平鲉基因组为参考基因组进行电子酶切预测,最终确定使用Hpy 166II酶切,酶切片段长度在314-344bp的序列定义为SLAF标签,预测到111,373个SLAF标签.实验中Hpy 166II的酶切效率为95.41%,共得到246.29Mreads,,测序平均Q30为87.62%,平均GC含量为40.92%.通过生物信息学分析,获得536,416个SLAF标签,其中多态性的SLAF标签共有222,120个,共得到1,413,339个群体SNP.
其他文献
Kisspeptin是调控GnRH的关键因子.Kisspeptin可以通过调节促性腺激素释放激素(gonadotropin releasing hormone,GnRH)的合成与释放来调节生殖活动.另一方面,kisspeptin还可以介导性类固醇激素的反馈调节.与哺乳类不同,大部分的硬骨鱼类中存在着两种kiss基因,揭示出硬骨鱼类中kisspeptin系统结构和功能的多样性.斜带石斑鱼是典型的雌雄
Kisspeptin由kiss1基因编码.哺乳类中,kisspeptin可以通过调节促性腺激素释放激素(gonadotropin releasing hormone,GnRH)来进一步调节促性腺激素(gonadotropinc hormone,GtH).同时,kisspeptin还可以介导性类固醇激素的反馈调节.与哺乳类不同,硬骨鱼类通常含有两种kiss基因,意味着鱼类中kiss信号系统的复杂性.
石斑鱼是蜚声世界的名贵海鲜,我国开展石斑类养殖始于二十世纪八、九十年代,为南方沿海养殖业的主要品种.石斑鱼养殖是经济效益显著的高值化技术产业,具有广阔的市场前景,其传统方式为海上网箱和池塘养殖两种模式.常见的石斑鱼养殖品种有二类,其一为传统的本地种,包括红斑(赤点石斑)、土斑(青石斑)、油斑(云纹石斑);另外是上世纪90年代从台湾引进的青斑(斜带石斑)、老虎斑(棕点石斑)和龙趸(鞍带石斑)以及后来
本实验研究了特种面包虫蛋白替代鱼粉对珍珠龙胆幼鱼生长性能、血清非特异性免疫指标和抗病力的影响.特种面包虫蛋白(商品名:天虫优)是由特殊选育出的面包虫FK03及其代谢产物加工而成的、含有多种功能物质的蛋白原料.用特种面包虫蛋白分别替代6.25%(T6)、12.5%(T12)、18.75%(T18)、25%(T25)、31.25%(T31)的鱼粉,以全鱼粉饲料为对照组(T0),配制6种等氮等能饲料.选
鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)生长快体型大,是石斑鱼属中体型最大的鱼类,但由于工人繁殖技术还未成熟,目前的养殖规模和数量较小.为了开发这一优良的鱼类种质资源,解决石斑鱼人工繁殖中雄鱼数量少、精液量不足,以及鞍带石斑与其它石鱼杂交育种中繁殖时间、地理分布的隔离问题,本文对鞍带石斑鱼的精子冷冻保存技术进行了研究.利用5%、10%和15%的二甲亚砜(DMSO)冷冻保存鞍带石
为探讨条纹锯鮨性逆转过程中内分泌调节机理,本文采用药条埋置的方法,分别将17α-甲基睾酮(17α-MT)和芳香化酶抑制剂(AI)药条单独和混合埋置到1+龄条纹锯鮨肌肉中,观察并分析性别转换过程中其组织学特征和生理学变化.结果显示,实验结束后,实验组条纹锯鮨已转化为功能性雄鱼,并获得有活力的精子,而对照组仅有少数个体转雄.(1)实验组条纹锯鮨性腺成熟系数先降低后升高,而对照组则变化不显著.随着埋置药
近20年来我国水产养殖业发展迅速,集约化高密度养殖成为发展趋势.然而这种集约化高密度养殖导致养殖水质却污染恶化,养殖水体有毒有害物质增加,使养殖生态系统严重失衡,导致细菌性、病毒性等病害的感染机率也随之增大,进而养殖对象发病死亡率增加,最终影响水产养殖业的健康发展.大量抗生素的使用使养殖环境更加恶化,细菌耐药性增加,抗生素在水产品中残留,又严重影响水产品安全.本文对微生物制剂的常用菌种、作用机理以
石斑鱼是名贵的海水鱼类,随着其养殖和繁育规模的不断扩大,各种疾病频频爆发,严重阻碍了石斑鱼产业的健康发展.其中弧菌是其病害中最重要的病原之一.弧菌病的爆发流行在全球均有发生,给渔业造成了严重的损失.石斑鱼弧菌病的防治方法主要有:化学药物、弧菌疫苗以及免疫增强剂等.关于弧菌病致病因子和石斑鱼免疫力的研究已取得一些成果,为开发弧菌亚单位疫苗和石斑鱼免疫系统研究奠定了基础.本文就近年石斑鱼常见弧菌病的致
由于斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)是我国当代水产行业重要的经济养殖鱼类,所以针对其快速、健康地生长和繁育的研究具有重要的意义.研究发现黑色素浓集激素(Melanin concentrating hormone,MCH)在许多生理内分泌活动中具有重要的调控作用,包括调节动物摄食行为、体重变化、能量平衡、睡眠觉醒、情绪压抑、攻击行为以及鱼类体色变化等功能.MCH主要通过与其受体
基因作为生命信息的承载体,包含着每个生命的全部奥密.基因组的研究,已经成为全面解读一个物种的重要突破口.石斑鱼是我国南方沿海广东、海南、福建等省的重要海水养殖鱼类之一,经济价值巨大.我们选取了斜带石斑鱼(Epinepheluscoioides)、棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)、鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)和赤点石斑鱼(Epineph