【摘 要】
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香港牡蛎,以滤食海水浮游生物为主,其肉质鲜美、营养丰富,是我国南方重要的经济养殖贝类.在育种上我们利用分子标记来辅助育种,以得到更优质高产的香港牡蛎.单核苷酸多态
【出 处】
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2013年中国科学院大学海洋科学学术论坛
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香港牡蛎,以滤食海水浮游生物为主,其肉质鲜美、营养丰富,是我国南方重要的经济养殖贝类.在育种上我们利用分子标记来辅助育种,以得到更优质高产的香港牡蛎.单核苷酸多态性(Simple Nucleotide Polymorphism,SNP)标记的出现使得香港牡蛎等海洋生物的育种学得到了极大地发展.SNP在基因组中分布广泛,密度高,并且易于自动化分析,非常适合建立遗传图谱用于辅助育种等研究.本研究以香港牡蛎为研究材料,进行香港牡蛎SNP标记的批量开发和检测.由于高分辨率熔解曲线法具有高的特异性和灵敏度,而且在大量样本的处理上方便、性价比也很高.所以本研究采取高分辨率熔解曲线法来对SNP进行检测.具体做法：运用Newbler软件对香港牡蛎转录组数据进行拼接,然后在拼接好的Contig序列中搜寻潜在的SNP位点.根据 SNP位点的侧翼序列设计引物,并进行聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选引物,再以高分辨率熔解曲线的方法对SNP进行检测,并在群体内开发出具多态性的SNP.
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