激活沉默基因簇发掘新颖安莎霉素

来源 :2013年中国科学院大学海洋科学学术论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:az4112513
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  我们课题组从福建厦门集美潮间带土样中分离得到一株链霉菌LZ35,通过基因组测序从中发现了一个新颖的安莎霉素生物合成基因簇,预测其编码的结构为新型八酮奈安莎霉素类化合物。对LZ35菌株进行多次大规模发酵和化学成分分离,未能获得该类化合物,推测该基因簇是沉默的。因此,我们采用了3条途径开展新型八酮安莎霉素基因簇的激活研究,分别为敲除基因簇特异的负调控基因、过表达基因簇特异的正调控基因和关键结构基因的启动子置换。通过对基因簇中负调控基因敲除突变株代谢产物的检测,未发现敲除突变株代谢产生明显的差异组分。通过对LZ35菌株启动子置换突变株代谢产物的检测和成分分离,获得到新型八酮安莎霉素的四酮前体。最终,通过对途径特异正调控基因LuxR过表达突变株代谢产物的检测和分离,得到了新型八酮萘安莎霉素。研究结果表明,通过genome mining的方法,采用适当的遗传操作手段可以激活微生物中沉默或隐性基因簇的表达,从而发现全新结构的次级代谢产物,为新药研究提供先导化合物。
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