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目的:比较同患者恶性胸水上清、白细胞层及离心细胞块三种不同成分DNA提取质量,探索最有效的胸水成分用于DNA提取及方法。方法:收集解放军175医院2014年细胞学及细胞块明确诊断恶性新鲜胸水5例,分别用胸水上清、白细胞层及离心细胞块三种不同成分进行DNA提取,然后对DNA含量和纯度进行测定,比较其DNA提取效果。结果:对同一患者胸水中白细胞层提取DNA含量最高,纯度次之,但对后续的EGFR基因突变和测序状况无影响;细胞块DNA提取质量次之,但纯度最高;胸水上清提取质量及纯度均最低。结论:恶性胸水DNA提取用于EGFR基因突变检测的最佳成份为离心白细胞层,离心细胞块次之,本实验组胸水上清提取效率不高。