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大型真菌大多数性状表现为受多基因控制的复杂数量性状,不仅遗传基础复杂,而且易受环境因子的影响.在构建分子遗传连锁图的基础上,进行重要性状的数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)定位研究,将为大型食用和药用真菌遗传改良奠定重要的基础.大型真菌分子遗传图谱及QTL定位研究起步晚,研究基础较为薄弱,其构建方法主要参考高等动植物的方法,主要以单孢分离群体SSI (single spore isolates)为作图群体,采用RAPD、AFLP、ISSR、SRAP、SSCP等分子标记技术.缺乏稳定且在基因组中分布相对均匀的分子标记是主要构建分子遗传图谱的主要限制因素.目前大型真菌分子遗传图谱的构建研究仅限于双孢蘑菇(Agaricus bisporus)、糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)、香菇(Lentinula edodes)、灰盖鬼伞(Coprinus cinereus)等少数种类.高密度的分子遗传图谱是QTL研究的基础,缺乏高密度的分子遗传图谱限制了大型真菌QTL研究,而作图群体与分离群体不一致是限制大型真菌QTL研究的另一主要因素.大型真菌中已经开展QTL研究的仅有双孢蘑菇、香菇、糙皮侧耳等少数几个种,其QTL作图主要采用区间作图法、复合区间作图法,采用的分离群体为测交群体、F2群体.大型真菌分子遗传图谱及QTL研究的目标是构建高密度遗传图谱,但达到这个目标必须使作图群体与性状分离群体一致,充分利用已知的功能基因标记,开展比较基因组学的研究,进行QTL精细定位和图位克隆,为开展分子辅助育种奠定基础.香菇是四极性异宗结合担子菌,作者以香菇杂交菌株(L6-26) 148个孢子单核体后代为作图群体,在鉴定各个菌株交配型的基础上,采用SSR、SRAP、TRAP和一个信息素受体基因片段对分离群体进行分子扩增分析,共获得702条多态性条带(2个SSR标记、一个信息素受体基因片段、225个SRAP标记位点、474个TRAP标记)和两个交配型位点.运用Joinmap作图软件进行数据分析,构建了一个包含有581个标记和位点,11个连锁群的香菇高密度分子遗传连锁图谱.图谱总长度为963.2 cM,连锁群的大小在21cM～151 cM之间,平均大小为87.6cM；标记间的距离在0～20.45 cM之间,标记间的平均距离为1.70 cM；两个交配型因子MAT-A、MAT-B分别定位在连锁群LG 3和LG 10上,大小分别为111cM和39cM；与MAT-A位点邻近的两个标记zip1-4-295和exg2-3-180距离MAT-A位点分别为6.6 cM和7.3 cM；与MAT-B位点邻近的两个标记zip1-4-390和exp1-4-190与MAT-B位点的距离分别为2.48 cM和6.55 cM；所构建的香菇高密度分子遗传连锁图谱在10cM、5 cM和2 cM以内一个标记的覆盖度分别为99.9％、98.9％和83.7％.平均图距为1.70 cM的香菇遗传连锁图谱是迄今为止的香菇遗传连锁图谱研究中图谱密度最高的,在5cM遗传距离内一个标记的覆盖度高达98.9％,为图位克隆、QTL数量性状定位、分子遗传育种等奠定了良好的基础.