【摘 要】
：
蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)在绝大多数细胞过程中扮演非常重要的作用,随着其结构数据的不断积累,越来越多的实例证明PPIs作为小分子药物靶标是可行的.为了更有效,全面
【机 构】
：
四川大学化学学院,四川省成都市,610064
论文部分内容阅读
蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)在绝大多数细胞过程中扮演非常重要的作用,随着其结构数据的不断积累,越来越多的实例证明PPIs作为小分子药物靶标是可行的.为了更有效,全面的预测新的PPIs药物靶标,本文结合机器学习算法—支持向量机(SVM)基于序列和结构信息评估PPIs的可药性.这里,我们第一次提出了由34个可药PPIs和122个不可药PPIs构成的非冗余数据集.此外,我们结合了多种特征选择方法,不同的正负样本比例,多种特征数目,建立288个模型,挑选其最优模型,并重复该过程100次,获取最具代表性的模型.最后,挑选出的模型在5次外部交叉验证中的准确率,灵敏度,特异性分别为94.18％,91.43％,95.19％,独立测试集结果也令人满意.
其他文献
档案专题数据库建设是信息化条件下档案信息资源开发利用的一项创新手段和重要途径,也是档案数字化建设的目标和任务之一,在今后档案信息化过程中,应当注重档案专题数据库的
牛奶是人们日常生活中不可或缺的食品，而市场上的液态奶品牌鱼龙混杂，良莠不齐，更有不法商贩假冒正牌乳制品造假出售，因此，液态奶品牌鉴别尤为重要[1]。目前液态乳制品的检测
课堂沉默即是学生参与课堂教学不足的现象.在面对教师的提问和指示时,和学生表现出漠不关心、不回答的态度,课堂上师生之间的交流较少.对此,课堂沉默的原因还有很多,除了师生
水生毒性是评价化学品对生态系统的影响的重要指标.在本研究中,采用分子描述和分子指纹结合不同的机器学习方法分别构建了基于不同鱼种的局部模型和全局模型.所有模型均
采用共沉淀法，分别制备了Au/CeO2、Au/ZnO、Au/Al2O3和Au/Fe2O3催化剂，并用XRD、BET、H2-TPR、O2-TPO、C2H5OH-TPD等对催化剂的晶相结构、比表面积、还原性能、抗积炭性及吸附
二茂铁基化合物由于其独特的结构、优异的性能和良好的燃速催化效果使得它们在高氯酸铵(AP)基固体推进剂中有广泛的应用。但是二茂铁及其小分子衍生物在固体推进中的迁移行为影响了其进一步发展。本论文围绕二茂铁基环氧化合物和二茂铁基聚合物的制备和性能展开研究:(1)合成了二茂铁酰基丙酸缩水甘油酯。采用1H-NMR、13C-NMR、FT-IR、MS等方法对产物进行了表征。采用循环伏安法研究了二茂铁酰基丙酸缩水
报款收入是报社主要收入来源之一,其管理也是各家报社财务管理的重点内容。温州报业发行广告有限公司(以下简称温报发行公司)通过管理手段和管理方式的大胆创新,取得报款回笼
目的：了解儿童肠道菌群中多种抗生素抗性基因的携带情况。方法：采集2.5-5.2岁儿童粪便标本,分别为3个月内未使用抗生素标本(对照组)8例和1周内使用过头孢类抗生素标本(抗生素组
代谢组学研究中的数据大多通过核磁共振气相色谱质谱联用或液相色谱质谱联用等分析仪器所获得,所得的这些数据的结构通常都是高维复杂的。本文将新近提出的质心收缩正则
定量构效关系(QSAR)模型自Corwin Hansch[1]首次提出已经经历了50多年的发展,随着化合物数据的增长,QSAR模型广泛引用于药学、化学工业的各个领域.使用QSAR模型不仅可节