水稻抗稻瘟病基因Pigm特异标记开发

来源 :中国植物病理学会2015年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mowill
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  水稻稻瘟病是影响水稻高产、稳产的重要病害.目前用于分子辅助育种的稻瘟病抗性基因中,抗病效果最佳的是Pigm基因.用于Pigm基因检测的常用标记包括功能标记M26205,InDel标记S29742与DG-3.其中,M26205是显性标记,在检测过程中表现不稳定,且不能区分纯合与杂合;而S29742在部分亲本间没有多态;DG-3与Pigm间存在分离,易引起误判.本研究综合利用生物信息学、基因克隆、关联分析等现代生物学技术,结合表型鉴定,筛选出Pigm抗性相关SNP位点,并选择性开发SNP标记S1088,S1806,S1914,S15390,S17137.经F2群体检测,标记S1806与表型完全共分离,且在检测过程中表现稳定.经136个不同水稻基因型分析,该标记检测结果与功能标记M26205完全一致.因此,新开发标记S1806不仅可用于分子辅助育种,还可用于不同水稻基因型Pigm基因的检测.
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