【摘 要】
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在真核生物中,转录因子可特异性结合DNA序列,精确调控遗传信息的转录过程,与细胞的代谢、周期、分化及死亡等各个过程密切相关。转录因子与DNA结合过程涉及到蛋白核酸相
【机 构】
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华中农业大学信息学院,湖北省武汉市洪山区狮子山街1号,430070
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在真核生物中,转录因子可特异性结合DNA序列,精确调控遗传信息的转录过程,与细胞的代谢、周期、分化及死亡等各个过程密切相关。转录因子与DNA结合过程涉及到蛋白核酸相互作用、蛋白蛋白相互作用、残基突变及单核酸多态性等诸多因素。目前我们对这些因素组合调控转录因子的特异性结合的分子机制还知之甚少。我们采用分子动力学模拟方法,并结合生物信息学统计信息,从蛋白蛋白相互作用、单核酸多态性等方面探讨了转录因子组合调控的分子机制。研究表面,BZIP家族中转录因子二聚体间因残基突变导致的蛋白蛋白相互作用减弱可诱导并增强蛋白核酸相互作用,从而导致转录因子对特异序列的选择性增强,这一结论与实验观察和生物信息学分析结果一致；单核酸多态性可导致DNA大沟和小沟的宽度和深度发生变化,从而传递和影响附近的小沟宽度,影响转录因子的结合强度,从而导致基因的上调和下调。这些研究成果对于揭示转录因子组合调控机制,理解转录调控过程具有积极意义,同时也对相关实验研究和药物开发具有借鉴意义。
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