【摘 要】
：
已有研究表明带负电荷含卤素的小分子能形成卤键,且在极性环境中更加稳定.通过对PDB数据库的调研,我们发现负电荷到卤素原子的距离变化很大.为了研究负电荷的距离对卤键
【机 构】
：
中国科学院上海药物研究所,上海市浦东新区张江高科技园区祖冲之路555号,201203
论文部分内容阅读
已有研究表明带负电荷含卤素的小分子能形成卤键,且在极性环境中更加稳定.通过对PDB数据库的调研,我们发现负电荷到卤素原子的距离变化很大.为了研究负电荷的距离对卤键强度的影响,我们设计了对位共轭烯酸卤代苯(-OOC-(C=C)n-ph-X,n=0-5)和氨所形成的卤键模型体系.通过量化计算发现,距离越长,卤键越强,在真空中尤其明显.能量分解结果表明负电荷卤键结合能中静电作用占主导地位.QM/MM 对蛋白体系的计算,也表明溶剂能使弱卤键变强,强卤键减弱.因此,通过调整负电荷到卤素的距离以及环境就能调节卤键的强度,这可以被应用于材料和药物设计领域.
其他文献
实验研究发现五元芳香偶氮吡唑具有极好的光异构化效率及热稳定性。然而,其光物理和光化学机理尚不清楚。我们对两种芳香偶氮吡唑(Z11和Z8)进行了电子结构计算和非绝热动
本文采用分子模拟方法探讨了双层石墨烯单轴压缩/拉伸变形的动力学过程。研究表明，单层石墨烯弯曲刚度取决于加载方向，而双层石墨烯弯曲刚度依赖于双层石墨烯层间相对取向
The aggregation of human islet amyloid polypeptide(IAPP)has an important implication in type 2 diabetes.The cytotoxicity of IAPP is proposed to be associate
为了更好地理解三种不同类型的氧化改性淀粉基胶粘剂的化学稳定性，耐水性以及剪裁粘度，采用AM1半经验和DFT-B3LYP水平的计算方法，一项详细的理论研究被完成。基于B3LYP计算
DNA逃逸ɑ-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减，意味着逃逸速率的含时涨落，即动力学无序。基于涨落瓶颈模型，将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。
通过借鉴控制平衡态解决热力学非平衡的方法,我们修正了传统非平衡溶剂化能计算的原理性错误,得到比传统理论较为准确的非平衡态溶剂化能,并将其应用到胞嘧啶在水溶液中
The iron(Ⅳ)-oxointermediate has been amply established as the principal oxidant in non-heme enzymes and the key player in C-H bond activations and function
比起一般的化学发光，生物发光的发光效率要高得多。生物发光效率定义为一个反应物产生光子的量子产率，可简单理解为反应产生化学激发态的效率(ΦCS)与该化学激发态的荧光效
多肽在蛋白表面的作用跟生物体内免疫防御、信号通路等多个过程有关.蛋白质与多肽对接过程对多肽新药研发及其设计有着指导意义.多肽的柔性增加了其与蛋白质对接的计算难