【摘 要】
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目的：胃癌的Lauren分型由于操作简单且易于使用,在胃癌的临床分型中被广泛采用.但对于不同Lauren分型胃癌背后的分子机制区别,尤其是基因组学层面的对比研究相对较少,目前依然缺乏在基因转录调控层面的对比研究.本研究旨在通过构建肠型和弥散型胃癌的特异性基因转录调控网络,结合表达谱分析,识别不同亚型胃癌的特异性分子标记物,揭示其潜在的分子机制.方法：基于GEO数据库中的GSE62254数据集,将全
【机 构】
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首都医科大学附属北京友谊医院消化内科,国家消化系统疾病临床医学研究中心,消化疾病癌前病变北京市重点实验室,北京消化中心,北京,100050
【出 处】
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2017中国医师协会消化医师分会年会
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目的：胃癌的Lauren分型由于操作简单且易于使用,在胃癌的临床分型中被广泛采用.但对于不同Lauren分型胃癌背后的分子机制区别,尤其是基因组学层面的对比研究相对较少,目前依然缺乏在基因转录调控层面的对比研究.本研究旨在通过构建肠型和弥散型胃癌的特异性基因转录调控网络,结合表达谱分析,识别不同亚型胃癌的特异性分子标记物,揭示其潜在的分子机制.方法：基于GEO数据库中的GSE62254数据集,将全部胃癌病例分为134例弥散型,146例肠型,20例混合型；在三种不同亚型的胃癌中,通过网络间属性传递的数据同化(Passing Attributes between Networks for Data Assimilation,PANDA),整合转录因子模块数据,构建“转录因子-靶基因”调控网络.通过对比网络差异与靶基因表达差异,识别关键的亚型特异性转录因子,用Kaplan-Meier曲线与Cox多因素风险回归评估其在不同亚型胃癌病例中的预后价值.结果：“转录因子-靶基因”调控网络在不同亚型的胃癌中有一定的保守性,85％以上的“转录因子-靶基因”调控线路在肠型、弥散型、混合型胃癌中共同存在.NFYA、FOXL1等13个转录因子在弥散型胃癌中显著激活,而RELA、TLX1等8个转录因子在肠型胃癌中显著激活.此外,我们发现弥散型胃癌RELA和FOXL1,SRY和NKX3-2,NFYA、PAX2和CREB1之间存在共调控效应；而肠型胃癌中,NKX2-5和NKX3-1,TFAP2A、EGR1和SP1存在共调控效应.在所有转录因子中,NFYA[RR (95％ CI)=0.560 (0.349, 0.900),p=0.017]和SRY [RR (95％ CI)=0.603 (0.375, 0.969),p=0.037]被识别为弥散型胃癌特异性的肿瘤标记物,而TLX1 [RR (95％ CI)=0.547 (0.321,0.9325),p=0.027]被识别为肠型胃癌的肿瘤标记物.结论：弥散型胃癌与肠型胃癌有着不同的基因转录调控网络,尤其是不同的转录因子共调控关系；针对这些转录因子的分析发现NFYA与SRY是弥散型胃癌的特异性预后标记物,而TLX1是肠型胃癌的特异性预后标记物.
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