【摘 要】
：
目的 探讨砷对肝脏microRNA表达的影响,筛选出敏感、稳定的应答microRNA,为后续研究提供基础数据.方法 SD雄性大鼠分别给予0,0.1,1,10及100 mg·L-1亚砷酸钠的饮用水,染毒60 d后,收集肝.每个剂量组选取3个样本,共15个样本,应用高通量RNA测序技术对所选取样本的microRNA表达进行定量.依照microRNA的表达谱对15个样本运用无监督层次法进行聚类分析,并且
【机 构】
：
School of Public Health and Health Professions, the State University of New York, Buffalo,NY 14214,
论文部分内容阅读
目的 探讨砷对肝脏microRNA表达的影响,筛选出敏感、稳定的应答microRNA,为后续研究提供基础数据.方法 SD雄性大鼠分别给予0,0.1,1,10及100 mg·L-1亚砷酸钠的饮用水,染毒60 d后,收集肝.每个剂量组选取3个样本,共15个样本,应用高通量RNA测序技术对所选取样本的microRNA表达进行定量.依照microRNA的表达谱对15个样本运用无监督层次法进行聚类分析,并且进行主成分分析.应用趋势检验分析microRNA的表达水平与砷浓度的关系.选取具有显著性差异表达的6个microR NA,应用实时定量PCR对其表达水平进行测定,验证RNA测序结果与实时定量PCR结果的一致性.结果 对15个样本进行聚类分析发现,聚类分组与砷接触浓度有统计学显著性关系(P=0.0012).剔除1个离群值,对其中14个样本的microRNA表达谱进行了主成分分析,结果表明砷接触水平对变异具有显著的贡献.对不同砷剂量组间的microRNA表达水平进行了分析,与对照组相比,miR-148b,mlR-151,mlR183,miR-192,miR-26a,及miR-423的表达水平发生明显改变,并且该变化与砷浓度呈明显的剂量-反应关系(趋势检验P＜ 0.01).运用实时定量PCR对上述6个microRNA的表达水平进行验证,结果表明miR151,miR-183,miR-26a及miR-423的表达水平随砷浓度变化具有显著的趋势性(P＜0.05),miR-148b的趋势性检验结果在界值附近(P=0.0669),miR-192的表达不随砷浓度的变化而变化(P＞0.1).对具有差异表达的microRNA的功能预测及文献结果分析表明,这些microRNA在功能上与砷毒性的形成与肿瘤的发生发展有关.结论 大鼠接触砷污染饮用水,可以引起肝脏microRNA表达的改变.
其他文献
目的 研究神经细胞上的NADPH氧化酶在炎症引起的神经退行性疾病中的作用.结果 脂多糖LPS引起的小胶质细胞激活,能够促进共处理的中脑原代神经细胞和多巴胺能神经元N27中NADPH氧化酶表达增加(包括其主要的亚基gp91phox,p47phox和p67phox).神经炎症反应能够促进中脑原代神经细胞中活性氧自由基(ROS)的产生,同时这种ROS的升高效果可以被NADPH氧化酶的抑制剂消除.对NAD
目的 研究丙烯酰胺(ACR)对Wistar大鼠原代DRG细胞NF-M转运速度的影响并初探其机制.方法 用ACR对原代培养的Wistar乳大鼠背根神经节细胞(DRG)染毒,用四甲基偶氮唑盐(MTT)确定受试物的染毒剂量.将质粒p-GFP-NFM和DsRED共转染进入DRG中,细胞培养48 h后ACR染毒(0,0.14,0.28 mmol· L-1).ACR染毒培养24 h后,将DRG置于荧光显微镜下
目的 研究乳腺非癌病例和不同分期的乳腺癌病例中FRY抑癌蛋白表达情况及其与临床病理参数之间的关系.方法 间接酶联免疫吸附实验(ELISA)及Western blot实验检测自制抗人FRY多克隆抗体特异性,并对20例乳腺癌病例用自制FRY多克隆抗体与商品化FRY抗体分别进行免疫组化检测,验证抗体的可行性；用自制FRY多克隆抗体对1 1例纤维囊性乳腺病及63例不同分期分级的乳腺癌病的中FRY蛋白表达情
目的 探讨咖啡酸苯乙酯(CAPE)是否可以通过调控核因子E2相关因子2(Nrf2)及抗氧化酶的表达而实现对肺成纤维细胞内氧化应激的改善,从而阻止其异常增殖与胶原分泌.这对于深入探讨肺纤维化的发病机理与防治策略具有重要意义.方法 给予小鼠肺成纤维细胞L929细胞H2O2 10 μmol·L-1及不同浓度的CAPE(1 ～50 μg·ml-1)预处理,24 h后应用RT-PCR与蛋白印迹法分别检测细胞
目的 观察氢醌(HQ)导致的氧化应激与PKM2蛋白表达的联系,进而了解ROS与PKM2的表达在苯致白血病中的作用,为预防和治疗苯导致的血液中毒提供新的依据.方法 颈椎脱臼8～10d昆明孕鼠取其卵黄囊,运用淋巴分离液及免疫磁珠法分(MACS)选出小鼠卵黄囊胚胎造血干细胞,种板于七种不同浓度氢醌的无血清培养基中染毒6h完成各种实验,流式细胞仪检测ROS的产生,real-time PCR检测Nrf2及其
以HepG2细胞为研究载体,考察人参中的主要皂苷成分Rg1对干预2,3,7,8-四氯代二苯并-对-二噁英(TCDD)诱导CYP1A1作用的影响mRNA、蛋白及酶活性三个层面影响进行了研究,同时对CYP1A1转录因子芳烃受体(AhR)表达也进行了考察,目的在于考察Rg1是否通过与TCDD共同作用于AhR,从而实现干预前致癌物如TCDD诱导CYP1A的能力,进而减少通过CYP1A1代谢活化产生致癌作用
目的 探讨ROS依赖性的p53活化在Cr(Ⅵ)诱导的肝细胞早衰中的作用机制.方法 用低剂量Cr(Ⅵ)处理L-02肝细胞,SA-β-Gal染色检测早衰的发生；流式细胞术分析细胞周期；用氧化敏感型荧光探针CM-H2DCFDA在荧光显微镜下检测ROS水平；检测Cr(Ⅵ)诱导的早衰肝细胞中线粒体呼吸链复合体(MRCC)Ⅰ～Ⅴ活性；检测有或无抗氧化剂NAC预处理时Cr(Ⅵ)作用后肝细胞中p53 mRNA表达
目的 探讨Polη缺陷对氢醌(HQ)所致肝细胞DNA损伤的影响.方法 将L02-POLH-nsc细胞(Polη表达正常的L-02肝细胞)和L02-POLH-sh细胞(Polη表达缺陷的L-02肝细胞)用HQ 0,10,20和40 μmol· L-1处理24 h后,采用彗星实验检测DNA损伤状况,并采用图像分析软件CASP-1.2.2对之进行分析,每个剂量组共分析100个细胞,以彗星的尾部DNA含量
目的 探讨孕烷X受体(PXR)作为转录因子对PP2A不同亚基基因的转录调控作用及其对外源化学物诱导肝细胞毒性转归的影响.方法 采用人肝L02细胞转染NR1/2基因构建PXR稳定高表达的L02-PXR细胞,以L02-pB空载体细胞为对照,给予已知的PXR诱导活化剂利福平(Rif,100μmol·L-1)处理48 h；Trizol法提取总RNA,qRT-PCR检测细胞中NR1/2和CYP3A4 mRN
目的 构建对盐酸米托蒽醌不同耐药程度的乳腺癌MCF-7耐药细胞系,并检测野生型及不同耐药程度细胞全基因组DNA甲基化水平,探讨多药耐药基因ABCG2差异表达的表观遗传学机制.方法 用0,0.005,0.01和0.02 μmol· L-1的盐酸米托蒽醌染毒细胞,建立对盐酸米托蒽醌不同耐药程度的MCF7/Mit耐药细胞系,采用流式细胞术检测各染毒组MCF-7细胞内药物蓄积量,确定耐药细胞系的建立；提取