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目的 探讨双向荧光差异凝胶电泳联合串联基质辅助激光解吸飞行质谱仪技术筛选出的原发性胆汁性肝硬化患者抗线粒体抗体阳性与阴性间血清标志物的意义.方法 采用双向荧光差异凝胶电泳获得4对抗线粒体抗体阳性/阴性的原发性胆汁性肝硬化患者的蛋白质差异表达图谱，运用生物信息学软件筛选得到差异表达的蛋白质，最后使用串联基质辅助激光解吸飞行质谱仪技术对这些蛋白质进行鉴定.结果 双向荧光差异凝胶电泳可在原发性胆汁性肝硬化患者中分离获得1840个蛋白质点.结果经生物信息学分析后发现，组间差异倍数＞1.5或＜-1.5以上的点共有28个差异点(P＜0.05).其中，抗线粒体抗体阳性组患者较阴性组表达上调的蛋白质点共9个，而相对表达下调的蛋白质点共19个.经进一步鉴定最终得到4个蛋白质，α1微球蛋白/bikunin前体、中间α球蛋白抑制因子H2、载脂蛋白A和补体因子H相关蛋白.结论 双向荧光差异凝胶电泳联合串联基质辅助激光解吸飞行质谱仪技术是筛选原发性胆汁性肝硬化患者抗线粒体抗体阳性与阴性间血清标志物的可靠技术.所发现的4种差异表达蛋白均为已报道的炎症相关蛋白或可能与PBC发病相关，对理解抗线粒体抗体阴性的原发性胆汁性肝硬化患者发病机制有着重要意义.