云南边境禽流感H5N1亚型病毒遗传多样性分析

• 作 者: 张武林 范泉水 张应国 张富强 张文东 赵焕云 齐绣花 吕粤 岳亮 邱薇 冯子良 郑颖
• 机 构: 湖南农业大学,湖南长沙410128成都军区疾病预防控制中心,云南昆明650118成都军区疾病预防控制中心,云南昆明650118云南省动物疫病预防控制中心,云南昆明650051云南农业大学,云南昆明65
• 出 处: 第二届全国禽病分子生物技术青年学者论坛
• 发表日期: 2011年11期
• 关键词: 禽流感病毒 HA基因 基因序列 遗传多样性

　　目的：阐明2009年～2011年7月期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒遗传多样性。方法：2009年～2011年7月期间在云南边境采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品，经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测，在阳性样品中扩增病毒HA基因，克隆至pMD18-T载体测序，并与已知参考毒株序列进行序列比对、同源性及系统发育分析。结果：36份代表性阳性样晶病毒HA基因测序获得15种HA序列，存在2个不同进化分支(2.3.2、2.3.4)，2.3.2进一步可划分为3个进化小分支(Ⅱ-1～Ⅱ-3)，2.3.4进一步可划分为2个进化小分支(Ⅰ-1和Ⅰ-2)。2.3.2Ⅱ-1、Ⅱ-2毒株是新出现的H5N1亚型病毒变异株。结论：2003年～2011年7月期间云南边境H5N1亚型病毒具有遗传多样性，病毒经历了单一(2.4)—多分支(1、2.3.2、2.3.4、2.4、7)—单一(2.3.4)—多分支(2.3.2、2.3.4)—单一(2.3.2)的进化过程。