LncRNA-UCA1与淮安食管癌发病风险的初步研究

来源 :中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第十六届全国学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:successfully_
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目的:初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的LncRNAs,为进一步研究与肿瘤相关的IncRNAs在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础.方法:分别提取3例患者食管癌组织及配对癌旁组织的总RNA,体外逆转录制备并标记为双链cDNA(ds-cDNA),与人类LncRNA表达谱芯片进行杂交,经扫描后,用Agilent GeneSpring GX v11.5.1软件进行分析运算,筛选出差异表达的LncRNAs.qRT-PCR分析LncRNA在食管癌细胞及组织中表达情况.结果:按照Fold Change≥2.0,P-value≤0.05的标准,筛选出表达差异有统计学意义的LncRNAs共1019个,其中399个上调,620个下调.GO分析和Pathway分析结果显示这些LncRNAs调控的差异表达的mRNAs主要与细胞周期、细胞分化、蛋白酶的活动等有关.结合Gibb食管癌相关的LncRNA差异表达谱分析发现IncRNA-UCAI可能参与食管癌发生发展.QRT-PCR结果显示,与永生化食管上皮细胞及癌旁组织相比,食管癌细胞及食管癌组织中IncRNA-UCA1均表达下调.结论:本次研究共筛选出1019个具有统计学意义的差异表达LncRNAs,其中LncRNAs-UCA1可能成为食管癌早期发现和诊断的生物标志物.
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