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本文利用亲和毛细管电泳表征荧光标记PNA(FAM-O-ggttggtgtggttgg，与人凝血酶Aptamer 15碱基序列相同)与牛血清白蛋白(BSA,pI=5.3)及转铁蛋白(Try pI=6.8)的相互作用，为PNA对蛋白质的识别及相互作用研究奠定基础。将BSA、Trf以浓度梯度加入电泳运行缓冲液中，随BSA、Trf浓度增加，PNA的迁移时间延长，Trf对迁移时间的影响强于BSA。PNA与电泳标记物FAM的迁移时间之比与Trf和BSA两种蛋白浓度的增加呈负相关，并呈现出斜率差异。说明肽核酸与两种蛋白的相互作用强度不同。