不同禽源副粘病毒分离株HN基因的克隆与序列分析

• 作 者: 王旋[1]黄兵[2]张训海[1]于可响[2]钟登科[1]宋敏训[2]龚争[1]赵磊[1]
• 机 构: 家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,安徽 233100
• 出 处: 中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会
• 发表日期: 2010年期

分别对源于安徽某地同期分离鉴定的鸡源、鸭源、鹅源NDV致病株(WF00C、WF00D、WF00G)的HN基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定，并对其核苷酸和推导氨基酸序列进行分析。结果显示，各分离株HN基因均含1个完整的开放阅读框(ORE)，全长为1716bp，编码571个氨基酸，有5个潜在的糖基化位点，13个半胱氨酸(Cys)残基。WF00D株与WF00C株、WF00G株以及Genebank下载的16株各基因型代表株的HN基因编码区的同源性进行比较，其核苷酸序列同源率为82.1～99.6[％]，推导的氨基酸序列同源率为88.1～99.3[％]；三个不同禽源分离株间的同源性较高，其中鸭源、鹅源同源性最高，并与ZJ1、SF02和NA_1等鹅源毒株和鸭源毒株FP1/02之间差异较小。HN基因系统发育进化树分析显示，该三个不同禽源NDV致病性分离株均归为基因Ⅶ型。