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科学研究过程存在诸多不确定因素，容易引发达不到预期效果的科研风险。本文旨在揭示科研过程的不确定性与科研风险的相互关系。在分析科研风险的本质特征及其与科研过程的相互关系的基础上，论述了在科研过程中引发的科研风险的类型及其形成机理，构建了反映科研过程和科研风险相互关系的理论模型。通过对来自15所985高校教师的157份有效调查问卷的实证分析表明：科研选题、学术构思、方案设计、科研实施、知识表达、成果转化等因素直接正向影响科研风险，而硬件支持和信息服务通过科研实施过程间接影响科研风险。结合实证分析结果，本文提出了基于科研过程的科研风险防范对策。本文的研究成果，揭示了源自于科研过程的科研风险的形成规律，也为研究机构识别与防范科研风险提供了理论依据和实践基础。