【摘 要】
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目的:整合素作为一种很重要的细胞黏附分子,属于跨膜蛋白;其对信号转导至关重要.预测整合素相互作用是生物信息学中一个重要的部分,对探索生命活动有着举足轻重的作用.结构域是蛋白质的结构和功能区域,在蛋白质相互作用中有着重要作用.近年来,已出现多种从结构域层面预测蛋白质间相互作用的方法,这些方法大多从蛋白质对入手,或统计某一对蛋白质对应的结构域对中能相互作用的概率,或利用大量的蛋白质结构信息找出某一对蛋
【机 构】
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太原理工大学应用力学与生物医学工程研究所,太原030024
【出 处】
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第十一届全国生物力学学术会议暨第十三届全国生物流变学学术会议
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目的:整合素作为一种很重要的细胞黏附分子,属于跨膜蛋白;其对信号转导至关重要.预测整合素相互作用是生物信息学中一个重要的部分,对探索生命活动有着举足轻重的作用.结构域是蛋白质的结构和功能区域,在蛋白质相互作用中有着重要作用.近年来,已出现多种从结构域层面预测蛋白质间相互作用的方法,这些方法大多从蛋白质对入手,或统计某一对蛋白质对应的结构域对中能相互作用的概率,或利用大量的蛋白质结构信息找出某一对蛋白质的结构中相互作用的结构域片段;然后建立模型,分析、优化、进行预测.其不足在于,这样需要大量的数据作为训练样本,并且预测结果的完整性也很难达到一个理想的状态.为了提高预测结果的完整性,使更有效的预测整合素之间的相互作用.方法:基于结构域之间的相互作用及其与整合素之间相互作用的关系,提出了一种预测整合素相互作用的新方法.首先把所预测的整合素蛋白质样本全部一一对应的分解到结构域层面.
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