【摘 要】
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[目的]研究饲养在西藏高原的放牧藏猪、舍饲藏猪和商品猪(杜长大猪,DLY猪)粪便中真菌群落组成的差异性,获取与饲粮粗纤维消化相关的真菌群落.[方法]以饲养在西藏高原的5月龄放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪为研究对象,采用消化试验测定放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪对饲粮粗纤维的表观消化率.采集粪便样品利用单分子实时测序技术(SMRT),测定粪便真菌ITS基因全长序列,分析粪便真菌群落的结构和多样性,采用Pearson相关分析获取饲粮粗纤维表观消化率与真菌群落的相关性.[结果]在放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的粪便样
【机 构】
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西藏农牧学院高原生态研究所,西藏林芝860000;西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000;西藏农牧学院食品科学学院,西藏林芝860000;西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000
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[目的]研究饲养在西藏高原的放牧藏猪、舍饲藏猪和商品猪(杜长大猪,DLY猪)粪便中真菌群落组成的差异性,获取与饲粮粗纤维消化相关的真菌群落.[方法]以饲养在西藏高原的5月龄放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪为研究对象,采用消化试验测定放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪对饲粮粗纤维的表观消化率.采集粪便样品利用单分子实时测序技术(SMRT),测定粪便真菌ITS基因全长序列,分析粪便真菌群落的结构和多样性,采用Pearson相关分析获取饲粮粗纤维表观消化率与真菌群落的相关性.[结果]在放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的粪便样品中共鉴定出了 4个门、13个纲、23个目、39个科、55个属、58个种,放牧藏猪在各分类水平的分类单元数均显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05).子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)是优势菌门,在门水平下,放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪间无显著差异(P≥0.05),但在纲、目、科、属、种水平下,放牧藏猪多个真菌类群相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05).放牧藏猪具有更高的菌群丰富度和独有分类操作单元(OTU)(P＜0.05),通过主坐标分析发现放牧藏猪粪便真菌群落与舍饲藏猪和DLY猪之间差距明显.放牧藏猪对饲粮粗纤维的表观消化率显著高于舍饲藏猪与 DLY 猪(P＜0.05),Pearson 相关性分析表明,Phialemonium atrogriseum、Phialemonium inflatum、Podospora communis与饲粮粗纤维表观消化率呈显著正相关(P＜0.05).[结论]放牧藏猪具有较强的纤维消化能力,可以从其肠道内鉴定出更丰富的真菌类群并进行深入开发,有利于进一步研究藏猪耐粗饲等优良特性.
其他文献
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[目的]囊泡病毒是一类体液传播的昆虫病毒,具有特殊的致病历程和良好的生防应用潜力.烟芽夜蛾囊泡病毒3h株(Heliothis virescens ascovirus 3h,HvAV-3h)是我国分离的第一株囊泡病毒,其编码的3H-117蛋白被报道为HvAV-3h病毒粒子的结构蛋白.[方法]为了进一步探究3h-117基因的功能,本研究以Bac-to-Bac昆虫表达系统为研究平台,将3h-117插入到苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(Autographacalifornica multiple nuclepolyh
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媒介昆虫的核心共生菌能被用作基因工程菌发挥抗病毒功能.灰飞虱是一种重要的农业害虫,其传播的水稻条纹病毒造成水稻的大面积减产甚至绝收.[目的]本研究对不同稻区及温室饲养的灰飞虱进行菌群组成分析并初步鉴定灰飞虱的核心共生菌.[方法]通过16SrDNA介导的二代测序技术,分析了 2018-2020年间采集自云南昆明、河南开封、河南范县稻区以及温室的灰飞虱的菌群组成.[结果]所有37个灰飞虱测序样本均携带细胞内和细胞外共生菌,细胞内生菌沃尔巴克氏体属(Wolbachia)为灰飞虱最稳定的核心共生菌,在所有样本中存
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[目的]通过分析胡杨叶片及树干内生细菌群落多样性、结构特征及生物学功能,探究内生细菌与宿主胡杨的互作机制.[方法]利用Illumina MiSeq高通量测序技术,对采集自新疆喀什地区胡杨林的3组胡杨树叶和3组树干样本的内生细菌进行Alpha、Beta多样性分析、群落组成分析以及通过比对代谢数据库进行群落功能预测,并对样品中内生细菌进行分离纯化鉴定.[结果]胡杨树叶优势菌群依次为变形菌门Proteobacteria(40.71％)、放线菌门Actinobacteria(21.76％)、拟杆菌门Bactero
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