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细粒粘连淀粉合成酶、淀粉分支酶1和淀粉分支酶3是关系到水稻胚乳中淀粉生物合成的3种主要酶。为了鉴定籼稻品种93-11和粳稻品种日本晴基因组数据库中的同源区域，已经使用了编码相应淀粉分支酶1和淀粉分支酶3的Sbe1、Sbe3基因的通用序列。使用序列多样性来开发出基因示踪标记，以便区分这两个位点Sbe1和Sbe3中的籼稻等位基因和粳稻等位基因。