【摘 要】
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西番莲是中国南方地区重要的热带水果,富含多种生物活性成分,具有较高的开发价值.本研究对'紫香1号'西番莲进行了基因组调查测序,总测序深度为134.52 ×,获得高质量数据200.9
【机 构】
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贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳,550006;罗甸县果业产业化发展办公室,罗甸,550100
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西番莲是中国南方地区重要的热带水果,富含多种生物活性成分,具有较高的开发价值.本研究对'紫香1号'西番莲进行了基因组调查测序,总测序深度为134.52 ×,获得高质量数据200.94 Gb.基于K-mer分析,预测基因组大小约为1 501 Mb,重复序列含量为76.11％,杂合度0.003％,GC含量42.82％.此外,在拼接的基因组序列中鉴定了202 272个SSR位点,其中含有单核苷酸重复基元的SSR位点有123 672个,占SSR总数的61.14％,其次是含有二核苷酸重复基元的SSR(53 951,26.67％)和含有三核苷酸重复基元的SSR(18 712,9.25％).本研究结果为确定西番莲全基因组测序策略和SSR分子标记开发提供了理论依据和参考.
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