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吐哈盆地已发现的油气藏几乎都分布在吐鲁番坳陷。该坳陷有两套主要烃源岩，有３ 种类型原油和３种类型天然气。油气源对比证实，台北型原油和煤型气来自中、下侏罗统煤系烃源岩，伊拉湖型原油和油型气来自二叠系和三叠系的湖相泥岩，火焰山型原油和过渡型气为混合来源，分布于两套烃源岩叠置区域。据此，吐鲁番坳陷存在两个含油气系统：Ｊ１ ＋ ２ － Ｊ２（ ！） 和Ｔ＋ Ｐ（ ！） 。Ｊ１ ＋ ２ －Ｊ２（ ！） 含油气系统是主要含油气系统，有效烃源岩为中、下侏罗统水西沟群以流水沼泽相为主的煤系泥岩和煤岩，主要分布在北部凹陷带