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主导产业对一个地区的经济发展有明显的推动作用，科学地评价其行业绩效，对更好地促进产业发展有重要意义。采用含有负值指标的BC。模型，从生产阶段的生产效率和经济效益，形成阶段的经济效率两个阶段对福建省2008年三大主导产业行业绩效进行评价，并利用聚类方法对评价结果进行聚类分析。结果表明：采用两阶段的DEA模型，容易发现各个子行业发展的薄弱环节，能为更好发展福建省主导产业提供决策参考。