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基因组编辑可以不含外源基因、近乎自然变异、高效地改变基因，将为农业等领域带来变革。但是，北海道大学安全卫生部的石井哲也副教授等于2014年2月发表在Trends in Plant Science杂志上关于基因组编辑技术为农业等领域带来的变革的文章中指出，正是因为“看似无痕迹的基因改变”在转基因生物（GMO）的现行管理上出现了界限不明的区域，由此产生了问题。还指出，要不断将转基因技术与基因组编辑技术的不同点传达给社会，要进一步正视基因组编辑作物在得到社会接纳上存在的问题。