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据中国学术期刊（光盘版）电子杂志社中国科学文献计量评价中心2010年11月发布的《中国学术期刊影响因子年报》（自然科学与工程技术·2010版），《生态环境学报》2009年的总被引频次5918次，影响因子为1．610，他引影响因子为1．455，他引率0．91，基金论文比为0．97（即96．8％），该年WEB下载量15．71万次。这些指标都是较高的，说明本刊的学术质量较高，学术影响力和作用较大。