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《环境微生物学》是环境工程与环境科学专业最重要的专业基础课之一，针对教学过程中学生普遍反映应用性不强的片面看法，做了热点话题引入教学过程；强调理论知识、实验技能与实际应用之间的内在联系；鼓励学生参与科学研究，主动解决实际问题；理论知识回顾与应用，提高毕业设计质量等四个方面的改革与实践，学生对本课程应用性有了较好的认识。