达氏鳇(Huso dauricus)生长激素基因挖掘及生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kuyedie222
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为进一步掌握生长激素(growth hormone,GH)基因在达氏鳇繁育、生长发育、基因多态性与生长性能相关性等方面的调控机制,本研究利用RACE扩增的方法获得了达氏鳇GH基因的全长cDNA序列,掌握达氏鳇GH基因序列的组成结构特点,并对GH蛋白进行了生物学信息分析.结果 显示,达氏鳇GH基因cDNA全长序列1 016 bp,5'非翻译区(5'-UTR)为125 bp,3'非翻译区(3'-UTR)为312bp,包含30bp的polyA尾巴,两个“AATAAA”,加尾信号分别位于PloyA上游227 bp和19 bp处.利用推测的GH蛋白的氨基酸序列进行物种内的同源性比对分析,达氏鳇与俄罗斯鲟的相似度最高,为97.94%;不同物种间的系统发育进化树显示,达氏鳇与人、其他哺乳动物等聚为一大支,与施氏鲟聚一小支.达氏鳇GH蛋白的生物学信息分析结果显示:GH蛋白是由214个氨基酸组成含有信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水性蛋白质,定位于细胞外,等电点为5.44;蛋白质二级结构中以α-螺旋和无规则蜷曲为主要元件;GH蛋白质含有15个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,4个苏氨酸(Thr)磷酸化位点,3个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点.本研究对达氏鳇生长基因GH进行了克隆,并对其进行了系统进化、蛋白理化性质、蛋白跨膜、蛋白亚细胞定位等研究,为今后深入了解GH基因在达氏鳇中的生物学功能提供理论基础.
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