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古河口湾沉积环境的恢复主要根据下列证据进行:1.淡化水证据:小个体薄壳生物组合和沉积物中低的硼含量;2.古地理位置处于古河流入海部位;3.潮汐能量大于河流能量,潮汐作用控制了主要沉积过程;4.沉积层序与现代河口湾层序可以类比。虽然河口湾生命短暂,沉积物常被改造,但一个时期的古代河口湾沉积物仍是可以被识别的。