【摘 要】
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目的建立反向斑点杂交技术,对泌尿生殖道沙眼衣原体感染进行检测和基因分型。方法用Oligo软件设计寡核苷酸探针,采用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增omp1基因的VS1-VS2序列,反向斑
【机 构】
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中山大学基础医学院; 中山大学基础医学院; 广东省皮肤性病防治中心;
【基金项目】
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广东省科委资助项目(2005B34201011);广东省卫生厅资助项目(A2005150)
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目的建立反向斑点杂交技术,对泌尿生殖道沙眼衣原体感染进行检测和基因分型。方法用Oligo软件设计寡核苷酸探针,采用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增omp1基因的VS1-VS2序列,反向斑点杂交技术对沙眼衣原体进行检测和基因分型。结果巢式PCR扩增omp1基因的VS1-VS2序列的敏感性与质粒PCR符合率为98.2%(56/57)。优选出11条型特异性(A、B+Ba、C、D、E、F、G、H、I、J和K)和3条群特异性寡核苷酸探针:B群(B、Ba、D和E型),C群(A、C、H、I、J和K型)和中间群(F和G型)。特异性经过基因库中的BLAST程序比较和试验优化,结果显示各探针均与标准株呈特异性杂交。56例VS1- VS2 PER阳性的临床标本杂交法检测均阳性,共检出59株沙眼衣原体,包括8个基因型,其中以E、F、D和H型为主,占77.9%,分别为25.4%,22.0%,16.9%和13.6%。发现3例混合感染占5.4%,分别为D/E、D/F和F/K。结论反向斑点杂交技术简便且快速,可直接对临床标本沙眼衣原体进行检测和基因分型。
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