甲型H7N9流感病毒血凝素和神经氨酸酶的进化及抗原位点变异分析

• 作 者: 李虎 胡鹏
• 机 构: 400010重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所,400010重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病
• 出 处: 中华医学杂志
• 发表日期: 2013年93期
• 关键词: 流感病毒A型 H7N9亚型 血凝素类 神经氨酸酶 抗原位点 进化 分子

目的

分析甲型H7N9流感病毒的血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）进化及其抗原位点变异。

方法

从美国国立生物技术信息中心（NCBI）和全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）数据库检索并下载从建库到2013年4月13日的H7N9病毒HA、NA的基因和氨基酸序列。应用Clustal-W、MEGA 5.0、NetNGlyc 1.0 Server、DNAMAN等生物信息学软件，对HA、NA的基因序列和氨基酸序列进行比对分析以及预测其潜在的抗原位点。

结果

共有26条HA基因和氨基酸序列以及24条NA基因和氨基酸序列纳入分析。美洲地区的H7N9流感病毒HA、NA基因和氨基酸的保守性较亚欧地区高。HA、NA基因进化分为亚欧地区和美洲地区两大系。所有病毒HA裂解位点附近仅含1个碱性氨基酸R（Arg）。HA蛋白裂解位点和NA蛋白糖基化位点表现出地区差异，HA蛋白糖基化位点保守。HA、NA蛋白在亚欧地区和美洲地区有多个抗原位点发生变异。7例中国分离的新型H7N9病毒进化位于亚欧地区分支，NA的茎部在69~73位有5个氨基酸缺失，HA蛋白裂解位点、糖基化位点未发生变异，HA、NA蛋白多个抗原位点发生了与其他病毒株不同的变异。

结论

H7N9病毒HA、NA进化表现出地区差异性。NA茎部氨基酸的缺失和HA、NA蛋白多个抗原位点的变异可能与人感染H7N9流感爆发有关。