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选用叶绿体rbcL基因对鸢尾属植物的分类和系统发育进行了分析。以雄黄兰为外类群，对21份鸢尾属材料和GenBank下载的共49条序列采用最大简约法构建系统进化树，探讨了鸢尾属的分类系统。针对有争议的物种，聚类结果表明：马蔺与白花马蔺关系较远；扁竹兰和蝴蝶花亲缘关系较扇形鸢尾近；细锐果鸢尾和锐果鸢尾亲缘关系近，大锐果鸢尾较之远；四川鸢尾和薄叶鸢尾聚类近；西伯利亚鸢尾系内物种间聚类复杂，亲缘关系不清楚。